271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0832 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 979 aa  2030    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  29.05 
 
 		 750 aa  292  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.76 
 
 		 743 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 766 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.64 
 
 		 913 aa  270  8e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 		 781 aa  253  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.44 
 
 		 781 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  29.94 
 
 		 862 aa  248  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  35.33 
 
 		 894 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  27.2 
 
 		 1015 aa  232  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  28.23 
 
 		 928 aa  231  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.96 
 
 		 858 aa  230  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.02 
 
 		 805 aa  217  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  31.92 
 
 		 785 aa  212  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 		 806 aa  212  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.52 
 
 		 787 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.9 
 
 		 704 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  30.39 
 
 		 804 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 		 984 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  30.39 
 
 		 804 aa  191  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.05 
 
 		 794 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.69 
 
 		 805 aa  189  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  31.13 
 
 		 763 aa  188  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.26 
 
 		 707 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 803 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  25.87 
 
 		 932 aa  184  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  24.12 
 
 		 1355 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.34 
 
 		 747 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  29.55 
 
 		 824 aa  181  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 754 aa  181  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.95 
 
 		 741 aa  180  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.84 
 
 		 748 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 925 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.14 
 
 		 813 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  25.45 
 
 		 897 aa  173  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  29.09 
 
 		 859 aa  171  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 832 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  24.8 
 
 		 848 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.15 
 
 		 986 aa  161  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.47 
 
 		 811 aa  160  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  22.89 
 
 		 815 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.29 
 
 		 903 aa  154  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 		 825 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  27.01 
 
 		 891 aa  152  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 888 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.15 
 
 		 922 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 919 aa  147  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  22.69 
 
 		 807 aa  147  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 		 987 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 		 1185 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.32 
 
 		 717 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  26.26 
 
 		 951 aa  142  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  24.87 
 
 		 799 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.6 
 
 		 808 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.05 
 
 		 686 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25 
 
 		 1013 aa  138  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.98 
 
 		 1781 aa  138  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.04 
 
 		 824 aa  137  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  24.81 
 
 		 738 aa  137  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  30.16 
 
 		 1019 aa  137  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  22.89 
 
 		 806 aa  135  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25.39 
 
 		 1455 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  23.06 
 
 		 827 aa  133  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.97 
 
 		 972 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  27.49 
 
 		 558 aa  132  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 655 aa  131  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 858 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 873 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.49 
 
 		 920 aa  128  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.08 
 
 		 837 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  22.66 
 
 		 961 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  29.03 
 
 		 1035 aa  126  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  24.85 
 
 		 1044 aa  126  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.63 
 
 		 1033 aa  125  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 1084 aa  125  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.45 
 
 		 1026 aa  125  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.13 
 
 		 920 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.52 
 
 		 1033 aa  124  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  26.06 
 
 		 1063 aa  124  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  27.12 
 
 		 1041 aa  124  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  25.65 
 
 		 964 aa  124  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.64 
 
 		 1036 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  26.84 
 
 		 1129 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  26.33 
 
 		 1029 aa  124  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  28.05 
 
 		 1023 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  26.09 
 
 		 1084 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  26.67 
 
 		 1008 aa  121  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 640 aa  121  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  25.05 
 
 		 644 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.4 
 
 		 1600 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  25.37 
 
 		 1031 aa  119  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  25.67 
 
 		 1108 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  25.42 
 
 		 1050 aa  117  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  26.56 
 
 		 1017 aa  117  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  25.42 
 
 		 1066 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  27.18 
 
 		 1035 aa  117  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  25.42 
 
 		 1066 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  23.77 
 
 		 1079 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  22.9 
 
 		 1175 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  25 
 
 		 1076 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>