More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0430 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  100 
 
 		 923 aa  1905    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  32.5 
 
 		 889 aa  382  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.57 
 
 		 892 aa  373  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.16 
 
 		 590 aa  209  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.04 
 
 		 884 aa  207  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  33.19 
 
 		 980 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.84 
 
 		 757 aa  197  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.53 
 
 		 800 aa  197  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.69 
 
 		 575 aa  197  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.15 
 
 		 595 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.72 
 
 		 799 aa  197  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.11 
 
 		 640 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 627 aa  194  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  34.09 
 
 		 613 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.49 
 
 		 901 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 593 aa  188  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32 
 
 		 864 aa  185  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.79 
 
 		 905 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.6 
 
 		 619 aa  184  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.46 
 
 		 640 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.16 
 
 		 614 aa  184  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.62 
 
 		 602 aa  182  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.2 
 
 		 614 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.62 
 
 		 604 aa  181  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.84 
 
 		 651 aa  181  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.26 
 
 		 614 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  27.36 
 
 		 600 aa  178  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.65 
 
 		 614 aa  177  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 603 aa  177  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 945 aa  177  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.52 
 
 		 620 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.63 
 
 		 623 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.56 
 
 		 738 aa  174  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.46 
 
 		 621 aa  174  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  28.59 
 
 		 623 aa  171  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.16 
 
 		 1064 aa  170  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  29.42 
 
 		 686 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 		 645 aa  168  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.57 
 
 		 603 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 		 626 aa  166  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.52 
 
 		 609 aa  164  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.63 
 
 		 929 aa  164  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.82 
 
 		 710 aa  163  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  27.51 
 
 		 591 aa  161  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  25.03 
 
 		 916 aa  162  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  28.63 
 
 		 597 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  29.58 
 
 		 584 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 		 803 aa  158  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  29.74 
 
 		 587 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 914 aa  154  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.54 
 
 		 932 aa  152  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  29.91 
 
 		 568 aa  149  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.77 
 
 		 607 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  29.7 
 
 		 743 aa  145  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  24.73 
 
 		 600 aa  145  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  28.41 
 
 		 563 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  27.98 
 
 		 564 aa  140  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  26.38 
 
 		 603 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  28.16 
 
 		 596 aa  137  7.000000000000001e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  26.41 
 
 		 558 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  26.03 
 
 		 604 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  25.84 
 
 		 603 aa  135  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.2 
 
 		 603 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  25.84 
 
 		 603 aa  135  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.2 
 
 		 603 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.2 
 
 		 603 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.2 
 
 		 603 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.38 
 
 		 603 aa  135  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.11 
 
 		 625 aa  134  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  27.56 
 
 		 590 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  27.11 
 
 		 577 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26 
 
 		 804 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.12 
 
 		 748 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.36 
 
 		 619 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.67 
 
 		 747 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 		 984 aa  133  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 754 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 		 598 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 925 aa  129  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25.78 
 
 		 804 aa  128  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  28.1 
 
 		 603 aa  127  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  24.49 
 
 		 599 aa  127  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  28.03 
 
 		 1063 aa  126  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  29 
 
 		 862 aa  125  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 832 aa  125  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.45 
 
 		 951 aa  124  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.11 
 
 		 972 aa  124  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.53 
 
 		 986 aa  124  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  29.15 
 
 		 1003 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3871  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.57 
 
 		 924 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  25.66 
 
 		 601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.14 
 
 		 805 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  26.57 
 
 		 1084 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.46 
 
 		 644 aa  120  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.96 
 
 		 1088 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  27.29 
 
 		 677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  27.39 
 
 		 670 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 1185 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 		 1084 aa  119  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 739 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>