More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22300 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  100 
 
 		 602 aa  1245    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  57.28 
 
 		 619 aa  686    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  46.73 
 
 		 932 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 		 626 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  42.96 
 
 		 600 aa  459  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  48.05 
 
 		 584 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.48 
 
 		 614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.26 
 
 		 620 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.59 
 
 		 800 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.83 
 
 		 884 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.16 
 
 		 905 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  39.49 
 
 		 640 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  39.06 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.73 
 
 		 901 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.54 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.61 
 
 		 799 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.02 
 
 		 609 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  40.07 
 
 		 575 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.29 
 
 		 757 aa  360  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  37.83 
 
 		 864 aa  342  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  37.81 
 
 		 980 aa  336  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.75 
 
 		 623 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.03 
 
 		 1064 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  36.3 
 
 		 613 aa  310  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  35.77 
 
 		 623 aa  277  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.29 
 
 		 614 aa  264  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.84 
 
 		 640 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  33.5 
 
 		 593 aa  261  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 		 627 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.39 
 
 		 614 aa  253  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.98 
 
 		 590 aa  252  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.87 
 
 		 604 aa  249  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.39 
 
 		 621 aa  247  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.6 
 
 		 595 aa  243  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  32.17 
 
 		 645 aa  233  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.87 
 
 		 651 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  29.99 
 
 		 945 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.78 
 
 		 892 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.47 
 
 		 710 aa  199  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  29.93 
 
 		 889 aa  194  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.72 
 
 		 923 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.52 
 
 		 815 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  26.99 
 
 		 1084 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  30.41 
 
 		 686 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 1084 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  29.07 
 
 		 597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  26.2 
 
 		 1036 aa  111  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  25.58 
 
 		 1045 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  26.68 
 
 		 1129 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.84 
 
 		 619 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.7 
 
 		 607 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.96 
 
 		 738 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  26.2 
 
 		 596 aa  107  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.7 
 
 		 968 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  25.38 
 
 		 1023 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  24.88 
 
 		 1355 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.48 
 
 		 1018 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.57 
 
 		 603 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.57 
 
 		 603 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  26.32 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.57 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.57 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.57 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  25.09 
 
 		 600 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  29.63 
 
 		 964 aa  101  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  26.79 
 
 		 590 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.62 
 
 		 744 aa  101  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.42 
 
 		 1033 aa  100  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  26.32 
 
 		 603 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.4 
 
 		 750 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  26.32 
 
 		 603 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  27.92 
 
 		 625 aa  99.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.26 
 
 		 1053 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  23.04 
 
 		 1455 aa  98.6  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  22.35 
 
 		 598 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.01 
 
 		 1036 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  26.41 
 
 		 1032 aa  97.4  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  26.98 
 
 		 1063 aa  97.4  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.43 
 
 		 803 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.16 
 
 		 992 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.07 
 
 		 603 aa  96.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.09 
 
 		 858 aa  96.3  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  27.51 
 
 		 1041 aa  95.9  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  23.64 
 
 		 1019 aa  95.1  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  29.75 
 
 		 916 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.28 
 
 		 1005 aa  94  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  23.51 
 
 		 1021 aa  94.4  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.83 
 
 		 1171 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  27.29 
 
 		 1028 aa  93.6  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  22.55 
 
 		 743 aa  93.2  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.8 
 
 		 1041 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.35 
 
 		 577 aa  93.2  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  24.82 
 
 		 1023 aa  93.6  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  25.39 
 
 		 644 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.08 
 
 		 972 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.74 
 
 		 1781 aa  92.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 785 aa  91.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  26.24 
 
 		 603 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  25.6 
 
 		 1008 aa  90.9  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  23.8 
 
 		 1026 aa  90.5  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>