268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07790 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  59 
 
 		 614 aa  705    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  61.97 
 
 		 614 aa  738    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  57.55 
 
 		 621 aa  677    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  100 
 
 		 651 aa  1313    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  38.87 
 
 		 623 aa  340  5e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.42 
 
 		 595 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.49 
 
 		 640 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  36.22 
 
 		 627 aa  317  6e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  33.44 
 
 		 593 aa  310  8e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.4 
 
 		 590 aa  298  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.63 
 
 		 710 aa  294  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  32.93 
 
 		 645 aa  286  8e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  37.19 
 
 		 575 aa  263  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.38 
 
 		 604 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 		 603 aa  247  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.74 
 
 		 623 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.31 
 
 		 1064 aa  241  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.06 
 
 		 620 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.87 
 
 		 614 aa  233  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.04 
 
 		 799 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.47 
 
 		 884 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.37 
 
 		 614 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.61 
 
 		 757 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.5 
 
 		 905 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.74 
 
 		 609 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.56 
 
 		 602 aa  215  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.12 
 
 		 864 aa  211  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.52 
 
 		 901 aa  207  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.7 
 
 		 980 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.64 
 
 		 932 aa  204  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  29.95 
 
 		 613 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.75 
 
 		 640 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.74 
 
 		 800 aa  193  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  30.61 
 
 		 600 aa  191  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.87 
 
 		 892 aa  191  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  30.22 
 
 		 889 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 626 aa  188  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.67 
 
 		 619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.6 
 
 		 923 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  33.86 
 
 		 584 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  29.66 
 
 		 945 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  29.25 
 
 		 590 aa  140  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  27.89 
 
 		 598 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.17 
 
 		 785 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  24.62 
 
 		 603 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.79 
 
 		 644 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  24.94 
 
 		 603 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.78 
 
 		 815 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  25.49 
 
 		 603 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  24.4 
 
 		 603 aa  106  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  24.4 
 
 		 603 aa  106  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  25.66 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  24.4 
 
 		 603 aa  106  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  25.49 
 
 		 603 aa  105  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.24 
 
 		 858 aa  104  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  25.49 
 
 		 603 aa  105  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.4 
 
 		 686 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  27.01 
 
 		 707 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  27.86 
 
 		 587 aa  98.6  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.84 
 
 		 704 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.32 
 
 		 596 aa  97.8  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.04 
 
 		 862 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.08 
 
 		 619 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  22.47 
 
 		 577 aa  96.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.54 
 
 		 929 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.76 
 
 		 598 aa  94.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  22.17 
 
 		 601 aa  92.8  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  23.75 
 
 		 1015 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.72 
 
 		 972 aa  91.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  24.71 
 
 		 558 aa  91.3  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  22.91 
 
 		 928 aa  89  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  23.86 
 
 		 1076 aa  88.6  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.98 
 
 		 1018 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.44 
 
 		 607 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  23.64 
 
 		 1035 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 		 987 aa  85.1  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  22.4 
 
 		 803 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.63 
 
 		 1033 aa  84.3  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.8 
 
 		 920 aa  84.3  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 781 aa  84  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.81 
 
 		 744 aa  83.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 		 1094 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  23.28 
 
 		 1355 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 766 aa  81.3  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  24.23 
 
 		 743 aa  81.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.51 
 
 		 787 aa  81.3  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.32 
 
 		 1781 aa  80.9  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.67 
 
 		 986 aa  80.1  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  22.27 
 
 		 1129 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  26.81 
 
 		 603 aa  80.1  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 		 951 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 781 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  25.05 
 
 		 1063 aa  79.7  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25.18 
 
 		 804 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  22.79 
 
 		 984 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 837 aa  78.2  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  23.81 
 
 		 738 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  23.8 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.05 
 
 		 913 aa  77.8  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>