More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0247 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  63.34 
 
 		 614 aa  796    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  56.85 
 
 		 603 aa  683    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 620 aa  1273    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  63.3 
 
 		 614 aa  786    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.58 
 
 		 799 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.34 
 
 		 901 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  44.3 
 
 		 640 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.73 
 
 		 905 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.81 
 
 		 884 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.72 
 
 		 757 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.13 
 
 		 609 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.58 
 
 		 800 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  43.36 
 
 		 575 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  41.28 
 
 		 864 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  40.1 
 
 		 980 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  40.99 
 
 		 600 aa  419  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.52 
 
 		 623 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.69 
 
 		 932 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  39.29 
 
 		 584 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 		 626 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  41.26 
 
 		 602 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.23 
 
 		 1064 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  38.36 
 
 		 613 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.46 
 
 		 619 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.22 
 
 		 640 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.87 
 
 		 590 aa  296  7e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  31.05 
 
 		 623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  31.87 
 
 		 593 aa  280  8e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 627 aa  272  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.67 
 
 		 614 aa  267  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.21 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  30.84 
 
 		 645 aa  261  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.44 
 
 		 614 aa  258  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.95 
 
 		 621 aa  246  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.1 
 
 		 604 aa  246  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.9 
 
 		 651 aa  236  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.89 
 
 		 892 aa  216  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  32.32 
 
 		 889 aa  198  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.64 
 
 		 710 aa  197  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 		 945 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.52 
 
 		 923 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.04 
 
 		 619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 		 925 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  29.58 
 
 		 803 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.88 
 
 		 750 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  27.42 
 
 		 1045 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.21 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.63 
 
 		 929 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.14 
 
 		 743 aa  101  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  24.36 
 
 		 686 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 		 984 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 951 aa  97.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.48 
 
 		 805 aa  97.1  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.8 
 
 		 804 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  25.05 
 
 		 928 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.78 
 
 		 824 aa  94.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  23.41 
 
 		 1455 aa  93.6  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 598 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 916 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.52 
 
 		 804 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  23.08 
 
 		 862 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 1175 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 858 aa  92  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.17 
 
 		 811 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  25.69 
 
 		 738 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.21 
 
 		 940 aa  90.9  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.67 
 
 		 794 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  24.26 
 
 		 1015 aa  90.5  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  22.92 
 
 		 587 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  22.51 
 
 		 625 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  23.81 
 
 		 1355 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 		 806 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  24.94 
 
 		 1023 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  24.48 
 
 		 972 aa  87.8  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  22.83 
 
 		 1129 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.72 
 
 		 600 aa  87.4  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  22.57 
 
 		 601 aa  85.1  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  24.93 
 
 		 1084 aa  84.7  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  22.99 
 
 		 596 aa  85.1  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.71 
 
 		 1781 aa  84.7  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  27.03 
 
 		 1019 aa  84  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  24.77 
 
 		 815 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  24.58 
 
 		 1041 aa  83.6  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25.97 
 
 		 763 aa  83.6  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.13 
 
 		 785 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.38 
 
 		 741 aa  83.2  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 1084 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.06 
 
 		 1033 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  24.94 
 
 		 670 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  24.62 
 
 		 1108 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  26.4 
 
 		 837 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  22.53 
 
 		 766 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 		 806 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  24.81 
 
 		 1030 aa  81.6  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.31 
 
 		 717 aa  81.6  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  23.17 
 
 		 1077 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 		 827 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 932 aa  80.9  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  23.22 
 
 		 832 aa  80.9  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  22.36 
 
 		 568 aa  80.5  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>