More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0290 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  52.66 
 
 		 873 aa  836    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 986 aa  2050    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  42.96 
 
 		 903 aa  687    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  42.64 
 
 		 922 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  45.55 
 
 		 919 aa  712    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.17 
 
 		 813 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  41.54 
 
 		 891 aa  615  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.85 
 
 		 824 aa  600  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.8 
 
 		 805 aa  570  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  38.94 
 
 		 827 aa  542  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  39.57 
 
 		 928 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  38.18 
 
 		 1015 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  37.69 
 
 		 832 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  37.4 
 
 		 1355 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  36.58 
 
 		 806 aa  495  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  43.29 
 
 		 604 aa  492  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.09 
 
 		 794 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.88 
 
 		 805 aa  455  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  35.07 
 
 		 961 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 		 932 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.98 
 
 		 1781 aa  430  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  35.21 
 
 		 1185 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  32.98 
 
 		 984 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 		 925 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.89 
 
 		 811 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.32 
 
 		 787 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.74 
 
 		 808 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  31.64 
 
 		 806 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  33.12 
 
 		 964 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.72 
 
 		 807 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.37 
 
 		 837 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  31.66 
 
 		 815 aa  361  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  29.82 
 
 		 858 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  29.88 
 
 		 799 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  29.37 
 
 		 859 aa  332  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  29.42 
 
 		 825 aa  330  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.08 
 
 		 1093 aa  311  5.9999999999999995e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 		 829 aa  309  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.99 
 
 		 882 aa  258  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  33.48 
 
 		 655 aa  248  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.5 
 
 		 750 aa  243  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.72 
 
 		 862 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.09 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 		 803 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 		 766 aa  205  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.14 
 
 		 897 aa  201  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.93 
 
 		 858 aa  200  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  27.22 
 
 		 707 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  25.84 
 
 		 785 aa  188  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  47.59 
 
 		 309 aa  187  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.62 
 
 		 1171 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 888 aa  177  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.99 
 
 		 704 aa  177  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  31.18 
 
 		 804 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 894 aa  168  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  31.1 
 
 		 804 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  28.61 
 
 		 763 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.53 
 
 		 913 aa  166  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 1175 aa  165  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.68 
 
 		 781 aa  164  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 		 979 aa  161  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 781 aa  161  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.54 
 
 		 824 aa  160  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.29 
 
 		 717 aa  158  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 		 754 aa  158  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.22 
 
 		 748 aa  155  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  29.38 
 
 		 951 aa  155  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.26 
 
 		 747 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  30.17 
 
 		 1019 aa  153  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.54 
 
 		 1264 aa  150  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  30.99 
 
 		 738 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.65 
 
 		 686 aa  144  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  27.42 
 
 		 1044 aa  140  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  28.4 
 
 		 598 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 		 987 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  34.2 
 
 		 233 aa  139  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.58 
 
 		 587 aa  138  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.25 
 
 		 1289 aa  138  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  29.69 
 
 		 564 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 1084 aa  137  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  27.6 
 
 		 596 aa  137  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.6 
 
 		 920 aa  137  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  27.17 
 
 		 670 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  26.28 
 
 		 1112 aa  136  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  27.19 
 
 		 848 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.38 
 
 		 1053 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 		 1049 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  28.39 
 
 		 563 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  28.26 
 
 		 1084 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.66 
 
 		 1030 aa  132  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.78 
 
 		 1026 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.34 
 
 		 1129 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.66 
 
 		 1030 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.5 
 
 		 1329 aa  130  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.42 
 
 		 1030 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.82 
 
 		 741 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.18 
 
 		 1030 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1030 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.32 
 
 		 598 aa  129  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.18 
 
 		 1030 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>