285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3226 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  51.59 
 
 		 825 aa  792    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 829 aa  1677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  53.3 
 
 		 799 aa  815    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.65 
 
 		 837 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.5 
 
 		 808 aa  511  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.05 
 
 		 794 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  49.9 
 
 		 655 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.59 
 
 		 882 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.51 
 
 		 811 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  35.8 
 
 		 815 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 		 807 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  31.14 
 
 		 1015 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  29.67 
 
 		 928 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.85 
 
 		 805 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 		 873 aa  356  8.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.92 
 
 		 903 aa  352  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 827 aa  337  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 		 806 aa  335  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  30.98 
 
 		 919 aa  334  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 858 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 806 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.53 
 
 		 922 aa  327  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.65 
 
 		 986 aa  310  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.67 
 
 		 1781 aa  306  8.000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  29.13 
 
 		 1355 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 		 1185 aa  301  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.47 
 
 		 787 aa  301  4e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  30.11 
 
 		 891 aa  300  6e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.87 
 
 		 824 aa  296  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  29.34 
 
 		 859 aa  296  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  28.59 
 
 		 925 aa  272  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 		 932 aa  270  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.2 
 
 		 813 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 832 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.3 
 
 		 1093 aa  252  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 984 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  26.75 
 
 		 961 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  28.37 
 
 		 604 aa  248  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.33 
 
 		 805 aa  239  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  28.83 
 
 		 964 aa  220  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.95 
 
 		 858 aa  179  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  30.47 
 
 		 750 aa  163  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.95 
 
 		 781 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 781 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  31.25 
 
 		 894 aa  154  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  28.01 
 
 		 897 aa  147  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  29.78 
 
 		 763 aa  145  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  29.06 
 
 		 862 aa  144  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  23.58 
 
 		 743 aa  138  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  34.58 
 
 		 972 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.13 
 
 		 913 aa  130  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 803 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  29.19 
 
 		 804 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 		 766 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  28.86 
 
 		 804 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.15 
 
 		 920 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 951 aa  125  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.99 
 
 		 738 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.14 
 
 		 1026 aa  122  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  26.55 
 
 		 1035 aa  122  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.02 
 
 		 747 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.21 
 
 		 748 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  29.62 
 
 		 888 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  27.2 
 
 		 1455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  23.98 
 
 		 704 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.65 
 
 		 686 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  28.03 
 
 		 785 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 987 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.82 
 
 		 824 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 979 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.61 
 
 		 1264 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 		 754 aa  112  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.55 
 
 		 1019 aa  111  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.35 
 
 		 920 aa  111  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  26.99 
 
 		 564 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.09 
 
 		 1289 aa  110  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  28.7 
 
 		 717 aa  110  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  27.4 
 
 		 1076 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 1175 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.03 
 
 		 563 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  29.55 
 
 		 1084 aa  108  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.36 
 
 		 1013 aa  108  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  29.19 
 
 		 1028 aa  108  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.52 
 
 		 1329 aa  108  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 		 1084 aa  107  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  26.72 
 
 		 1108 aa  107  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  26.76 
 
 		 1129 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  29.31 
 
 		 1024 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  27.89 
 
 		 707 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  26.8 
 
 		 1024 aa  105  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 1043 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  27.7 
 
 		 1041 aa  105  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  25.38 
 
 		 599 aa  104  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  26.1 
 
 		 1049 aa  104  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.37 
 
 		 741 aa  104  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  24.8 
 
 		 1112 aa  103  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 628 aa  103  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.23 
 
 		 1030 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.89 
 
 		 1035 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  28.28 
 
 		 1029 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>