155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2936 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  100 
 
 		 309 aa  636    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  60.46 
 
 		 922 aa  341  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  60.23 
 
 		 919 aa  324  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  58.96 
 
 		 903 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  48.85 
 
 		 891 aa  263  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  45.49 
 
 		 873 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.59 
 
 		 986 aa  187  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.93 
 
 		 813 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  46.75 
 
 		 805 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.86 
 
 		 824 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.34 
 
 		 794 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  42.69 
 
 		 1015 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  41.38 
 
 		 806 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  40.12 
 
 		 827 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  39.15 
 
 		 811 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  41.28 
 
 		 1355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  36.63 
 
 		 859 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  41.78 
 
 		 806 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 		 925 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.1 
 
 		 1781 aa  127  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  39.53 
 
 		 932 aa  122  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  37.29 
 
 		 807 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  45.97 
 
 		 928 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 		 858 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  34.5 
 
 		 984 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.75 
 
 		 787 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.7 
 
 		 805 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  34.3 
 
 		 815 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  36.05 
 
 		 961 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  39.38 
 
 		 832 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.94 
 
 		 808 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.82 
 
 		 1093 aa  99.4  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  34.94 
 
 		 964 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.53 
 
 		 837 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  34.25 
 
 		 707 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  32.58 
 
 		 862 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  29.95 
 
 		 897 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  37.35 
 
 		 829 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  34.9 
 
 		 704 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.82 
 
 		 858 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 		 825 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  32.73 
 
 		 799 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 1185 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 		 888 aa  85.9  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  33.51 
 
 		 1171 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  35.81 
 
 		 655 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 979 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  35.42 
 
 		 763 aa  79.3  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 		 803 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  30.61 
 
 		 750 aa  76.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  27.91 
 
 		 743 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  31.72 
 
 		 785 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  29.44 
 
 		 1175 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  30.05 
 
 		 824 aa  72.4  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  28.3 
 
 		 677 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.74 
 
 		 717 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25.97 
 
 		 804 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.33 
 
 		 882 aa  66.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.52 
 
 		 804 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.66 
 
 		 913 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  23.97 
 
 		 1017 aa  63.9  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 		 781 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.19 
 
 		 781 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 1094 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  30.93 
 
 		 766 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  31.58 
 
 		 894 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.96 
 
 		 1289 aa  60.1  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 1049 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.89 
 
 		 1036 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  26.58 
 
 		 951 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.32 
 
 		 1013 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.42 
 
 		 1329 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.53 
 
 		 1264 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 1144 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 972 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 1077 aa  55.8  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  22.48 
 
 		 1043 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 598 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  21.88 
 
 		 1455 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.38 
 
 		 1053 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  24.34 
 
 		 686 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  23.86 
 
 		 1035 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  30.65 
 
 		 587 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  26.75 
 
 		 670 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.12 
 
 		 614 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 		 1084 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  24.55 
 
 		 1084 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  34.72 
 
 		 603 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  34.72 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  34.72 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 		 1079 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  34.72 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  34.72 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 		 640 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  34.72 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  34.72 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.6 
 
 		 640 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  34.72 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.37 
 
 		 738 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  25.14 
 
 		 625 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>