293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2734 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  47.79 
 
 
888 aa  870    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  100 
 
 
897 aa  1856    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  42.74 
 
 
717 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  36.68 
 
 
704 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  37.99 
 
 
707 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  31.39 
 
 
862 aa  383  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  30.4 
 
 
894 aa  283  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 
806 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 
803 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.62 
 
 
805 aa  248  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.7 
 
 
824 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  28.47 
 
 
1015 aa  239  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  27.29 
 
 
827 aa  237  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 
984 aa  237  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  29.35 
 
 
928 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.27 
 
 
805 aa  231  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  28.36 
 
 
848 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 
919 aa  226  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
832 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.92 
 
 
903 aa  220  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 
873 aa  220  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.72 
 
 
1171 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 
807 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  31.08 
 
 
587 aa  211  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 
925 aa  210  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  26.41 
 
 
891 aa  210  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.4 
 
 
922 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 
932 aa  207  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 
806 aa  204  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 
598 aa  204  8e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.66 
 
 
986 aa  202  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 
1175 aa  197  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.95 
 
 
811 aa  197  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.13 
 
 
813 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  24.19 
 
 
859 aa  195  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 
858 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  28.59 
 
 
558 aa  192  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.66 
 
 
858 aa  192  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  26.85 
 
 
964 aa  191  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  28.9 
 
 
599 aa  189  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.75 
 
 
603 aa  189  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  25.56 
 
 
1355 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  24.14 
 
 
961 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  25.63 
 
 
781 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.24 
 
 
1781 aa  184  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.49 
 
 
781 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.85 
 
 
607 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.78 
 
 
750 aa  181  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.11 
 
 
824 aa  177  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 
979 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  26.32 
 
 
588 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  25.4 
 
 
601 aa  175  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  27.88 
 
 
670 aa  174  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.51 
 
 
1093 aa  173  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  28.01 
 
 
596 aa  172  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.87 
 
 
568 aa  172  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  24.88 
 
 
577 aa  170  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  26.69 
 
 
591 aa  169  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  23.82 
 
 
743 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  29.24 
 
 
597 aa  168  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 
825 aa  167  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.36 
 
 
794 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  27.6 
 
 
600 aa  164  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  28.11 
 
 
590 aa  164  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 
799 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  27.93 
 
 
603 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.4 
 
 
787 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.97 
 
 
625 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.43 
 
 
598 aa  162  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  27.03 
 
 
563 aa  161  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  24.89 
 
 
763 aa  160  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  28.99 
 
 
815 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  26.37 
 
 
564 aa  159  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.67 
 
 
644 aa  158  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  28.77 
 
 
604 aa  157  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  26.93 
 
 
603 aa  157  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  28.3 
 
 
512 aa  156  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.4 
 
 
913 aa  155  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  26.48 
 
 
603 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  26.48 
 
 
603 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  27.03 
 
 
598 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.17 
 
 
603 aa  152  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.32 
 
 
603 aa  152  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  30.33 
 
 
738 aa  152  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.32 
 
 
603 aa  151  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.32 
 
 
603 aa  151  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.32 
 
 
603 aa  151  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  27.4 
 
 
804 aa  150  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  29.18 
 
 
604 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.31 
 
 
808 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 
829 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  23.88 
 
 
677 aa  145  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  27.64 
 
 
804 aa  145  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 
766 aa  144  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  25.54 
 
 
785 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 
655 aa  140  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.48 
 
 
686 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.92 
 
 
837 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  28.08 
 
 
1129 aa  138  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 
1079 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>