274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4133 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  74.53 
 
 		 747 aa  1194    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  74.33 
 
 		 748 aa  1191    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 754 aa  1560    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  42.44 
 
 		 741 aa  626  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  49.2 
 
 		 804 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  49.27 
 
 		 804 aa  621  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  39.84 
 
 		 743 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  41.04 
 
 		 750 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 766 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.54 
 
 		 785 aa  248  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 781 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.83 
 
 		 781 aa  210  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 803 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.47 
 
 		 913 aa  193  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  26.4 
 
 		 928 aa  187  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.85 
 
 		 862 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 979 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  23.9 
 
 		 763 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  30.03 
 
 		 894 aa  174  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.72 
 
 		 805 aa  173  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 		 919 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 832 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  23.41 
 
 		 1015 aa  160  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.49 
 
 		 858 aa  160  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.58 
 
 		 986 aa  158  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.01 
 
 		 563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  28.04 
 
 		 738 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  25.81 
 
 		 891 aa  154  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.55 
 
 		 805 aa  153  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 		 827 aa  153  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  25.87 
 
 		 564 aa  153  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  29.3 
 
 		 848 aa  151  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  30.95 
 
 		 972 aa  150  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.03 
 
 		 808 aa  149  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 		 925 aa  147  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  33.91 
 
 		 1043 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.87 
 
 		 903 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  24.74 
 
 		 961 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 932 aa  145  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.74 
 
 		 794 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  27.97 
 
 		 590 aa  144  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 806 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.5 
 
 		 837 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  28.67 
 
 		 824 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.03 
 
 		 1781 aa  142  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  32.37 
 
 		 1020 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.7 
 
 		 811 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.77 
 
 		 1033 aa  141  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  27.15 
 
 		 1045 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  28.36 
 
 		 598 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.94 
 
 		 787 aa  140  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.78 
 
 		 922 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 873 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  31.61 
 
 		 1084 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.22 
 
 		 587 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  29.27 
 
 		 1019 aa  138  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  28.61 
 
 		 1059 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.3 
 
 		 568 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  27.86 
 
 		 597 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.14 
 
 		 686 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  28.24 
 
 		 558 aa  135  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.32 
 
 		 625 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 		 1084 aa  134  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.12 
 
 		 600 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 984 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 		 987 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  24.8 
 
 		 1035 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.54 
 
 		 1289 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 		 1077 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.14 
 
 		 598 aa  132  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.17 
 
 		 923 aa  132  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  28.65 
 
 		 1076 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.14 
 
 		 813 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  30.05 
 
 		 1129 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  25.62 
 
 		 1044 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.01 
 
 		 1013 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  29.35 
 
 		 1035 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  24.22 
 
 		 1046 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.85 
 
 		 1063 aa  127  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  23.57 
 
 		 1355 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  25.99 
 
 		 1108 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.18 
 
 		 1005 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.81 
 
 		 623 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  27.13 
 
 		 604 aa  124  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.08 
 
 		 1264 aa  123  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 825 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.43 
 
 		 1026 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  23.94 
 
 		 964 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.49 
 
 		 920 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 		 1049 aa  121  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 1094 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  24.01 
 
 		 596 aa  121  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  25 
 
 		 577 aa  120  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  26.83 
 
 		 1112 aa  120  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.25 
 
 		 1424 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 1079 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  29.5 
 
 		 1028 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 		 951 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.59 
 
 		 1018 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  27.93 
 
 		 1003 aa  119  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>