More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0102 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  39.59 
 
 		 1355 aa  873    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 1781 aa  3646    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.22 
 
 		 1093 aa  691    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  39.65 
 
 		 1015 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  39.49 
 
 		 928 aa  552  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 		 827 aa  519  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.03 
 
 		 805 aa  516  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  34.69 
 
 		 806 aa  506  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.1 
 
 		 813 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  33.52 
 
 		 1185 aa  466  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 873 aa  436  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.6 
 
 		 824 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.98 
 
 		 986 aa  429  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 		 832 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 		 919 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.83 
 
 		 903 aa  416  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.79 
 
 		 922 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.31 
 
 		 787 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  32.91 
 
 		 806 aa  400  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.93 
 
 		 794 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 		 984 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  31.77 
 
 		 815 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  30.44 
 
 		 891 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  32.86 
 
 		 964 aa  369  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  29.85 
 
 		 859 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.24 
 
 		 805 aa  369  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.83 
 
 		 807 aa  364  8e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  30.87 
 
 		 961 aa  363  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.07 
 
 		 811 aa  361  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 858 aa  355  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 932 aa  353  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  30.27 
 
 		 925 aa  352  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  29.04 
 
 		 825 aa  317  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 		 799 aa  311  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.48 
 
 		 837 aa  311  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 829 aa  295  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  31.03 
 
 		 604 aa  291  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.03 
 
 		 808 aa  290  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  31.52 
 
 		 655 aa  242  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  23.84 
 
 		 750 aa  221  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.69 
 
 		 858 aa  205  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.17 
 
 		 862 aa  201  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.31 
 
 		 743 aa  194  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  25.56 
 
 		 897 aa  185  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.84 
 
 		 882 aa  179  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  23.53 
 
 		 824 aa  169  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.51 
 
 		 707 aa  169  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 		 888 aa  167  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25.85 
 
 		 804 aa  162  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.46 
 
 		 748 aa  160  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.19 
 
 		 1171 aa  158  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.87 
 
 		 686 aa  155  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.36 
 
 		 704 aa  155  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25.44 
 
 		 804 aa  155  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.88 
 
 		 747 aa  154  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 		 979 aa  154  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.97 
 
 		 913 aa  154  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 803 aa  152  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  23.69 
 
 		 717 aa  148  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.17 
 
 		 738 aa  148  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.71 
 
 		 1129 aa  147  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 		 754 aa  145  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  29.67 
 
 		 785 aa  144  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.37 
 
 		 1033 aa  139  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.62 
 
 		 972 aa  138  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  22.02 
 
 		 766 aa  138  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  25.55 
 
 		 894 aa  137  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  25.16 
 
 		 1044 aa  135  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 781 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.19 
 
 		 741 aa  132  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  28.42 
 
 		 763 aa  131  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.97 
 
 		 781 aa  131  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.62 
 
 		 1264 aa  130  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  25.51 
 
 		 1108 aa  130  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  39.1 
 
 		 309 aa  127  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  23.29 
 
 		 1175 aa  127  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.38 
 
 		 1041 aa  126  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.93 
 
 		 1026 aa  123  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  22.14 
 
 		 848 aa  123  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  25.89 
 
 		 1063 aa  122  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.61 
 
 		 596 aa  122  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.29 
 
 		 1013 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  26.72 
 
 		 598 aa  120  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  26.09 
 
 		 1045 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.99 
 
 		 1005 aa  119  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 628 aa  119  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  24.26 
 
 		 1041 aa  118  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  24.44 
 
 		 601 aa  116  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  26.42 
 
 		 1076 aa  116  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 951 aa  116  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 987 aa  115  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 1094 aa  115  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  24.79 
 
 		 1046 aa  115  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  23.51 
 
 		 1059 aa  115  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 1043 aa  115  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.51 
 
 		 1033 aa  115  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  27.85 
 
 		 1019 aa  114  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  25.87 
 
 		 1003 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.17 
 
 		 1003 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  26.74 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>