272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0288 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 628 aa  1306    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  57.1 
 
 		 640 aa  764    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  49.44 
 
 		 1013 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  43.79 
 
 		 1026 aa  536  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  43.52 
 
 		 1008 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  41.09 
 
 		 1023 aa  485  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  41.05 
 
 		 1012 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  39.42 
 
 		 1005 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  38.15 
 
 		 1455 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  38.34 
 
 		 1084 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  36.41 
 
 		 1094 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  37.67 
 
 		 1084 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.66 
 
 		 1033 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  34.81 
 
 		 1049 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 		 1079 aa  363  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  35.48 
 
 		 1129 aa  361  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  34.43 
 
 		 1045 aa  361  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  34.33 
 
 		 1045 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  35.15 
 
 		 1023 aa  353  5e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  35.35 
 
 		 1044 aa  352  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.63 
 
 		 1026 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  33.54 
 
 		 1043 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  34.91 
 
 		 1035 aa  347  4e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  35.38 
 
 		 1031 aa  346  8e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  34.18 
 
 		 1063 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.35 
 
 		 1289 aa  343  4e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.52 
 
 		 1030 aa  343  5.999999999999999e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.39 
 
 		 1053 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.7 
 
 		 1033 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  33.65 
 
 		 1035 aa  340  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  33.92 
 
 		 1046 aa  340  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  33.39 
 
 		 1041 aa  340  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  33.86 
 
 		 1024 aa  339  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  33.95 
 
 		 1032 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.97 
 
 		 1264 aa  336  5.999999999999999e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  33.75 
 
 		 1029 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.64 
 
 		 1041 aa  331  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  32.65 
 
 		 1077 aa  329  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  34.52 
 
 		 1043 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  34.74 
 
 		 1036 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  33.22 
 
 		 1024 aa  327  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  34.21 
 
 		 1043 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.33 
 
 		 1030 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.65 
 
 		 1036 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  33.86 
 
 		 1024 aa  327  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  33.86 
 
 		 1024 aa  326  6e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  33.86 
 
 		 1024 aa  326  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  32.56 
 
 		 1050 aa  326  9e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  33.86 
 
 		 1024 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.86 
 
 		 1024 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  32.56 
 
 		 1066 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  32.56 
 
 		 1066 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1024 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  33.7 
 
 		 1024 aa  324  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  32.87 
 
 		 1028 aa  323  7e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  32.39 
 
 		 1059 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  31.8 
 
 		 1076 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.77 
 
 		 1030 aa  321  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33 
 
 		 1018 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  32.61 
 
 		 1112 aa  319  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.61 
 
 		 1030 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  32.61 
 
 		 1030 aa  317  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1030 aa  317  6e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.61 
 
 		 1030 aa  316  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.61 
 
 		 1030 aa  316  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.65 
 
 		 1030 aa  316  8e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.65 
 
 		 1030 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  34.17 
 
 		 1019 aa  315  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  31.48 
 
 		 1108 aa  313  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  33.23 
 
 		 1032 aa  310  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  31.39 
 
 		 1012 aa  307  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  31.84 
 
 		 1164 aa  308  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  33.33 
 
 		 1003 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.54 
 
 		 1004 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  31.33 
 
 		 1009 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.67 
 
 		 968 aa  304  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  32.76 
 
 		 1020 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.11 
 
 		 1003 aa  300  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  32.67 
 
 		 1043 aa  299  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 1020 aa  299  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  33.13 
 
 		 1036 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.5 
 
 		 1329 aa  292  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.44 
 
 		 992 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  32.11 
 
 		 1017 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  29.15 
 
 		 1030 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.49 
 
 		 992 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.43 
 
 		 996 aa  266  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  30.31 
 
 		 1021 aa  259  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.89 
 
 		 1424 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  38.25 
 
 		 1022 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 1017 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.19 
 
 		 1600 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  31.87 
 
 		 349 aa  173  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 987 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.61 
 
 		 920 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.93 
 
 		 920 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 		 951 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.15 
 
 		 743 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.73 
 
 		 972 aa  126  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.66 
 
 		 805 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>