More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4634 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 1424 aa  2883    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.61 
 
 		 1600 aa  429  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  42.11 
 
 		 1033 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  39.93 
 
 		 1084 aa  399  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 		 1084 aa  396  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  40.98 
 
 		 1063 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  35.61 
 
 		 1455 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  38.12 
 
 		 1019 aa  376  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  37.59 
 
 		 1045 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  37.55 
 
 		 1035 aa  373  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  39.18 
 
 		 1044 aa  372  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  37.83 
 
 		 1129 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  39.31 
 
 		 1041 aa  365  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 		 1077 aa  365  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  38.06 
 
 		 1076 aa  363  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  35.27 
 
 		 1046 aa  362  4e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.71 
 
 		 1026 aa  357  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  35.73 
 
 		 1059 aa  357  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  36.99 
 
 		 1024 aa  354  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  36.19 
 
 		 1079 aa  353  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  36.96 
 
 		 1029 aa  352  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  33.7 
 
 		 1108 aa  352  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.23 
 
 		 1013 aa  352  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  36.41 
 
 		 1050 aa  348  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  36.41 
 
 		 1066 aa  348  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  36.41 
 
 		 1066 aa  348  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  37.41 
 
 		 1028 aa  346  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 		 1043 aa  343  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  35.73 
 
 		 1036 aa  341  7e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  37.41 
 
 		 1024 aa  340  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  37.43 
 
 		 1032 aa  340  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.82 
 
 		 1289 aa  337  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 		 1049 aa  333  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  36.14 
 
 		 1036 aa  333  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  33.61 
 
 		 1164 aa  332  4e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  39.05 
 
 		 1094 aa  330  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  34.99 
 
 		 1045 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  37.37 
 
 		 1024 aa  329  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  37.37 
 
 		 1024 aa  328  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  37.37 
 
 		 1024 aa  328  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.37 
 
 		 1024 aa  328  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1024 aa  328  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  35.74 
 
 		 1043 aa  328  7e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  37.19 
 
 		 1024 aa  327  9e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  34.89 
 
 		 1031 aa  326  2e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  34.87 
 
 		 1035 aa  326  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.51 
 
 		 1041 aa  325  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  35.09 
 
 		 1043 aa  324  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  36.74 
 
 		 1023 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  34.75 
 
 		 1020 aa  322  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  33.81 
 
 		 1021 aa  322  5e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  36.08 
 
 		 1017 aa  320  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  36.36 
 
 		 1043 aa  318  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  36.71 
 
 		 1024 aa  316  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.34 
 
 		 1053 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  37.82 
 
 		 1012 aa  312  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.27 
 
 		 1264 aa  313  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.7 
 
 		 1030 aa  312  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.15 
 
 		 1005 aa  311  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  37.45 
 
 		 1003 aa  310  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  35.66 
 
 		 1032 aa  309  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.93 
 
 		 1036 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  34.81 
 
 		 1030 aa  307  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1030 aa  307  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  35.07 
 
 		 1030 aa  306  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.81 
 
 		 1030 aa  306  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.52 
 
 		 1030 aa  306  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.7 
 
 		 1030 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.81 
 
 		 1030 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.64 
 
 		 1030 aa  305  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.43 
 
 		 1003 aa  304  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  34.08 
 
 		 1026 aa  304  8.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.76 
 
 		 992 aa  301  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.07 
 
 		 1018 aa  301  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.77 
 
 		 1030 aa  301  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.22 
 
 		 1004 aa  296  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  32.08 
 
 		 1112 aa  295  6e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  34.05 
 
 		 1020 aa  291  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  34.21 
 
 		 1008 aa  289  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.32 
 
 		 1030 aa  289  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.52 
 
 		 968 aa  287  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  33.22 
 
 		 1023 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.99 
 
 		 1033 aa  279  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  30.39 
 
 		 1012 aa  276  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  30.45 
 
 		 1009 aa  275  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  36.03 
 
 		 992 aa  267  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.05 
 
 		 1329 aa  259  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 640 aa  252  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 		 628 aa  238  7e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.01 
 
 		 996 aa  231  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  39.79 
 
 		 1017 aa  209  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  42.07 
 
 		 1022 aa  208  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.6 
 
 		 920 aa  171  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  33.52 
 
 		 349 aa  169  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  30.71 
 
 		 972 aa  168  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 987 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.72 
 
 		 951 aa  163  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  41.15 
 
 		 1392 aa  157  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.03 
 
 		 920 aa  154  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 		 803 aa  140  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>