88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3712 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  100 
 
 
1392 aa  2810    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  39.65 
 
 
996 aa  287  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.938367 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  41.43 
 
 
985 aa  276  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  34.76 
 
 
892 aa  175  5.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.62 
 
 
1424 aa  166  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  32.98 
 
 
625 aa  162  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  32.95 
 
 
780 aa  157  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  31.75 
 
 
579 aa  147  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  40.91 
 
 
693 aa  147  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  40.38 
 
 
924 aa  146  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  32.23 
 
 
586 aa  145  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  33.14 
 
 
584 aa  144  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  34.06 
 
 
898 aa  144  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  31.46 
 
 
598 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  33.43 
 
 
799 aa  142  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  32.79 
 
 
584 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  31.25 
 
 
586 aa  142  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  46.62 
 
 
970 aa  139  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  43.02 
 
 
601 aa  138  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  46.62 
 
 
693 aa  137  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  32.71 
 
 
576 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  32.42 
 
 
580 aa  135  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  31.47 
 
 
631 aa  135  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  45.86 
 
 
1193 aa  130  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  31.1 
 
 
612 aa  126  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  30.79 
 
 
612 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  45.65 
 
 
1206 aa  123  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  30.71 
 
 
586 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  45.99 
 
 
812 aa  122  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  31.08 
 
 
613 aa  121  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  42.35 
 
 
1236 aa  121  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  28.02 
 
 
610 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  28.57 
 
 
827 aa  112  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  36.42 
 
 
739 aa  110  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  28.15 
 
 
801 aa  110  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  42.03 
 
 
1295 aa  108  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  33.91 
 
 
796 aa  101  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  28.78 
 
 
632 aa  101  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00194  beta-galactosidase (Eurofung)  25.89 
 
 
642 aa  96.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.433212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  33.84 
 
 
802 aa  95.9  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  27.57 
 
 
643 aa  95.1  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  32.53 
 
 
832 aa  94  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  35.5 
 
 
808 aa  91.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  36.09 
 
 
1069 aa  84  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  28.15 
 
 
1193 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  30.4 
 
 
850 aa  80.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  34.4 
 
 
672 aa  76.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  32.58 
 
 
2142 aa  75.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  31.97 
 
 
1479 aa  73.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  40.68 
 
 
1413 aa  71.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  35.43 
 
 
1049 aa  70.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  30.1 
 
 
837 aa  70.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  29.9 
 
 
682 aa  68.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  26.18 
 
 
1687 aa  67.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  33.76 
 
 
642 aa  65.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  30 
 
 
644 aa  63.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  35.71 
 
 
633 aa  63.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  24.6 
 
 
1465 aa  60.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  32.79 
 
 
665 aa  60.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  31.25 
 
 
641 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  27.27 
 
 
677 aa  59.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  31.01 
 
 
1405 aa  58.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  36.17 
 
 
975 aa  58.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  34.91 
 
 
1013 aa  58.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.62 
 
 
1212 aa  58.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  32.52 
 
 
373 aa  57.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  29.37 
 
 
1455 aa  57.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  28.03 
 
 
669 aa  56.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1891  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 
362 aa  55.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  34.26 
 
 
636 aa  55.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  35 
 
 
711 aa  54.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  32.39 
 
 
1121 aa  53.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  31.58 
 
 
658 aa  52.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  32.81 
 
 
631 aa  52  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  27.34 
 
 
372 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  28.19 
 
 
755 aa  50.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  28.83 
 
 
1011 aa  48.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  23.74 
 
 
932 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  26.36 
 
 
1108 aa  47.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  33.65 
 
 
723 aa  48.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.59 
 
 
694 aa  47.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
491 aa  47.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  34.33 
 
 
713 aa  47.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.06 
 
 
517 aa  47.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  27.5 
 
 
814 aa  46.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  24.77 
 
 
693 aa  46.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.54 
 
 
1343 aa  45.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.93 
 
 
1357 aa  45.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>