More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1973 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.33 
 
 		 1033 aa  744    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  62.01 
 
 		 1030 aa  1333    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  62.01 
 
 		 1030 aa  1332    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.16 
 
 		 1026 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  100 
 
 		 1030 aa  2140    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  62.5 
 
 		 1030 aa  1342    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  61.91 
 
 		 1030 aa  1330    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  62.01 
 
 		 1030 aa  1333    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  60.31 
 
 		 1032 aa  1323    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  37.42 
 
 		 1024 aa  729    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.98 
 
 		 1041 aa  687    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  62.01 
 
 		 1030 aa  1335    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  62.01 
 
 		 1030 aa  1333    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  37.24 
 
 		 1063 aa  721    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  62.11 
 
 		 1030 aa  1334    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  35.78 
 
 		 1084 aa  627  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 		 1084 aa  620  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  35.6 
 
 		 1023 aa  618  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  35.99 
 
 		 1003 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  33.96 
 
 		 1030 aa  598  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  33.3 
 
 		 1079 aa  594  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  33.37 
 
 		 1049 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  35.92 
 
 		 1044 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.33 
 
 		 1030 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  34.48 
 
 		 1043 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  34.87 
 
 		 1028 aa  559  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  32.12 
 
 		 1108 aa  562  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.01 
 
 		 1018 aa  555  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  34.1 
 
 		 1035 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  34.69 
 
 		 1043 aa  544  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  35.43 
 
 		 1043 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  34.72 
 
 		 1029 aa  545  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  30.79 
 
 		 1043 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  34.82 
 
 		 1020 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.92 
 
 		 968 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  33.58 
 
 		 1041 aa  541  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  33.75 
 
 		 1036 aa  542  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  32.05 
 
 		 1045 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  31.05 
 
 		 1012 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  31.3 
 
 		 1059 aa  532  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  31.25 
 
 		 1009 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  33.85 
 
 		 1024 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  34.04 
 
 		 1036 aa  529  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  33.37 
 
 		 1021 aa  528  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  33.84 
 
 		 1094 aa  529  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.85 
 
 		 992 aa  524  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  33.11 
 
 		 1032 aa  525  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  32.79 
 
 		 1019 aa  524  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  31.73 
 
 		 1455 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  33.85 
 
 		 1024 aa  525  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  33.85 
 
 		 1024 aa  525  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  33.49 
 
 		 1024 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.49 
 
 		 1024 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1024 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  31.99 
 
 		 1076 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.16 
 
 		 1003 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  33.37 
 
 		 1024 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  33.4 
 
 		 1024 aa  519  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  31.04 
 
 		 1164 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  31.02 
 
 		 1129 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  32.89 
 
 		 1050 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 1045 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  32.7 
 
 		 1066 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  32.92 
 
 		 1031 aa  511  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.62 
 
 		 1036 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  32.6 
 
 		 1066 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.57 
 
 		 992 aa  508  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 		 1077 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  32.06 
 
 		 1035 aa  507  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.31 
 
 		 1053 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.38 
 
 		 1013 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  30.51 
 
 		 1112 aa  498  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.03 
 
 		 1004 aa  496  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.5 
 
 		 996 aa  483  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.78 
 
 		 1033 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  28.23 
 
 		 1046 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.31 
 
 		 1289 aa  477  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  32.56 
 
 		 1020 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  32 
 
 		 1012 aa  465  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.73 
 
 		 1264 aa  462  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  31.53 
 
 		 1017 aa  456  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 1022 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.87 
 
 		 1329 aa  455  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  30.79 
 
 		 1026 aa  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  30.7 
 
 		 1023 aa  437  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  31.63 
 
 		 1008 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.54 
 
 		 1005 aa  435  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 1017 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 		 640 aa  355  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  34.52 
 
 		 628 aa  343  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.77 
 
 		 1424 aa  300  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03337  beta-D-galactosidase, alpha subunit  57.94 
 
 		 245 aa  293  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.05 
 
 		 1600 aa  273  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  36.36 
 
 		 349 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.86 
 
 		 920 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 987 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.78 
 
 		 972 aa  176  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.69 
 
 		 920 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  21.65 
 
 		 951 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 806 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>