275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3379 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  100 
 
 
992 aa  1960    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  46.07 
 
 
1003 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  42.61 
 
 
996 aa  669    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  45.94 
 
 
1004 aa  768    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  47.5 
 
 
1020 aa  796    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  45.22 
 
 
1018 aa  761    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  61.38 
 
 
992 aa  1093    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  39.49 
 
 
1041 aa  651    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  50.29 
 
 
1003 aa  867    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  52.27 
 
 
968 aa  853    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  41.46 
 
 
1033 aa  630  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  40.29 
 
 
1063 aa  627  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.81 
 
 
1026 aa  595  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  34.07 
 
 
1024 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  35.64 
 
 
1023 aa  541  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  35.3 
 
 
1084 aa  538  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  33.4 
 
 
1032 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  33.74 
 
 
1164 aa  532  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  34.09 
 
 
1084 aa  531  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.91 
 
 
1030 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  35.06 
 
 
1030 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  35 
 
 
1030 aa  519  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  35.12 
 
 
1030 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.85 
 
 
1030 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  35.02 
 
 
1030 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  35.02 
 
 
1030 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  35.12 
 
 
1030 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  35.12 
 
 
1030 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  35.02 
 
 
1030 aa  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  36.61 
 
 
1020 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  33.95 
 
 
1029 aa  501  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  31.43 
 
 
1012 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.87 
 
 
1030 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  31 
 
 
1009 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  34.71 
 
 
1043 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  33.81 
 
 
1021 aa  492  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  33.6 
 
 
1041 aa  489  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  33.14 
 
 
1031 aa  488  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  34.94 
 
 
1043 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  32.56 
 
 
1035 aa  485  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  35.62 
 
 
1043 aa  486  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  34.75 
 
 
1024 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.75 
 
 
1024 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  34.27 
 
 
1024 aa  482  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  34.75 
 
 
1024 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  34.65 
 
 
1024 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  34.65 
 
 
1024 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  34.55 
 
 
1024 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  33.27 
 
 
1044 aa  479  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  34.28 
 
 
1036 aa  475  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  33.86 
 
 
1028 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  31.58 
 
 
1019 aa  470  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  32.12 
 
 
1036 aa  472  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  33.37 
 
 
1032 aa  469  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  30.67 
 
 
1455 aa  465  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  32.91 
 
 
1129 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  33.43 
 
 
1024 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  31.49 
 
 
1079 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  30.86 
 
 
1050 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  30.85 
 
 
1066 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.77 
 
 
1013 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  29.32 
 
 
1108 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 
1094 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 
1049 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.12 
 
 
1036 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.21 
 
 
1264 aa  429  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  33.53 
 
 
1008 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  32.2 
 
 
1023 aa  422  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  32.04 
 
 
1045 aa  422  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  34.52 
 
 
1012 aa  418  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  30.92 
 
 
1035 aa  419  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.05 
 
 
1053 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  31.94 
 
 
1076 aa  415  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  30.98 
 
 
1059 aa  416  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  36.17 
 
 
1066 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  31.32 
 
 
1077 aa  411  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  30.12 
 
 
1026 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.78 
 
 
1033 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  28.68 
 
 
1046 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 
1043 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.8 
 
 
1289 aa  396  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  30.44 
 
 
1017 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  29.87 
 
 
1045 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  30.13 
 
 
1112 aa  375  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.24 
 
 
1005 aa  373  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.71 
 
 
1329 aa  363  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  35.18 
 
 
1022 aa  329  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  35.61 
 
 
1017 aa  318  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.76 
 
 
1424 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 
640 aa  298  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  33.44 
 
 
628 aa  292  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  38.46 
 
 
349 aa  235  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.7 
 
 
920 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.81 
 
 
1600 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 
987 aa  197  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.39 
 
 
920 aa  194  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
951 aa  164  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  30.1 
 
 
972 aa  151  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.02 
 
 
741 aa  139  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  29.78 
 
 
563 aa  137  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>