262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3187 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  52.35 
 
 
1017 aa  987    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  40.75 
 
 
1020 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  40.68 
 
 
1043 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1022 aa  2062    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.94 
 
 
1041 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  34.12 
 
 
1063 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  31.64 
 
 
1164 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.48 
 
 
1026 aa  499  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 
1079 aa  482  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 
1043 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  33.33 
 
 
1044 aa  473  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  31.62 
 
 
1035 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  28.95 
 
 
1108 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  30.34 
 
 
1030 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.16 
 
 
1033 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  30.2 
 
 
1045 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  31.11 
 
 
1035 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  30.14 
 
 
1049 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  29.45 
 
 
1032 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  32.51 
 
 
1029 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  31.14 
 
 
1036 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  28.31 
 
 
1455 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  31.01 
 
 
1129 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.85 
 
 
1033 aa  439  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  32.24 
 
 
1036 aa  436  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  31.38 
 
 
1028 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  30.32 
 
 
1041 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  29.77 
 
 
1030 aa  422  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  31.86 
 
 
1076 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29 
 
 
1053 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.69 
 
 
1289 aa  414  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.44 
 
 
1013 aa  406  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  26.63 
 
 
1012 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  32.98 
 
 
1024 aa  403  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  26.83 
 
 
1009 aa  406  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.02 
 
 
1264 aa  399  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  37.28 
 
 
1066 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  37.28 
 
 
1050 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  37.28 
 
 
1066 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  30.63 
 
 
1112 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  34.5 
 
 
1084 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.98 
 
 
968 aa  389  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  30.36 
 
 
1059 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.88 
 
 
1036 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  34.96 
 
 
1084 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  28.92 
 
 
1017 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  36.15 
 
 
1003 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  33.55 
 
 
1030 aa  376  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  35.22 
 
 
1024 aa  376  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  32.2 
 
 
1031 aa  370  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  35.52 
 
 
1024 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  35.12 
 
 
1024 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  35.12 
 
 
1024 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.12 
 
 
1024 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  27.23 
 
 
1021 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  35.12 
 
 
1024 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  35.26 
 
 
1024 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  34.85 
 
 
1024 aa  366  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.66 
 
 
1018 aa  365  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  33.57 
 
 
1019 aa  362  3e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  30.89 
 
 
1046 aa  361  5e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  34.26 
 
 
1043 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  34.57 
 
 
1043 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  34.28 
 
 
1032 aa  356  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  32.22 
 
 
1045 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.91 
 
 
1005 aa  350  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  31.66 
 
 
1023 aa  344  5.999999999999999e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  34.32 
 
 
1094 aa  342  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 
1077 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.94 
 
 
1004 aa  337  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 
1020 aa  337  5.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.51 
 
 
1030 aa  337  7e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  32.82 
 
 
1023 aa  337  9e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  32.33 
 
 
1026 aa  335  3e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.98 
 
 
1003 aa  334  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.87 
 
 
992 aa  328  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  30.25 
 
 
1030 aa  326  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  30.39 
 
 
1030 aa  327  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  30.25 
 
 
1030 aa  325  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  30.25 
 
 
1030 aa  325  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  30.25 
 
 
1030 aa  325  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  30.25 
 
 
1030 aa  325  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.18 
 
 
992 aa  324  5e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.25 
 
 
1030 aa  323  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.56 
 
 
996 aa  323  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  34 
 
 
1012 aa  316  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  33.01 
 
 
1008 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.88 
 
 
1329 aa  278  4e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 
628 aa  265  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.6 
 
 
1424 aa  257  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.62 
 
 
1600 aa  252  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 
640 aa  237  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  35.75 
 
 
349 aa  224  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 
987 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.89 
 
 
972 aa  181  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.29 
 
 
920 aa  152  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  22.61 
 
 
951 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.51 
 
 
920 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.37 
 
 
858 aa  125  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
766 aa  117  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>