More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0998 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  43.2 
 
 		 1008 aa  746    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  56.06 
 
 		 1005 aa  1089    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  41.97 
 
 		 1013 aa  806    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  39.98 
 
 		 1023 aa  697    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  36.07 
 
 		 1455 aa  674    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  39.69 
 
 		 1026 aa  727    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  100 
 
 		 1012 aa  2068    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  35.36 
 
 		 1084 aa  597  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  35.76 
 
 		 1084 aa  598  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 		 1079 aa  566  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  36.14 
 
 		 1063 aa  554  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  34.38 
 
 		 1129 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  33.87 
 
 		 1049 aa  546  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  35.88 
 
 		 1094 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  32.25 
 
 		 1046 aa  539  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.3 
 
 		 1033 aa  536  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  33.1 
 
 		 1019 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  33.6 
 
 		 1045 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  30.79 
 
 		 1043 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  33.43 
 
 		 1035 aa  519  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  32.45 
 
 		 1077 aa  515  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  33.01 
 
 		 1164 aa  516  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  32.38 
 
 		 1035 aa  507  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  34.3 
 
 		 1029 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  31.6 
 
 		 1059 aa  498  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.84 
 
 		 1026 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  33.56 
 
 		 1024 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  32.69 
 
 		 1044 aa  496  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  41.6 
 
 		 640 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  33.59 
 
 		 1023 aa  486  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  30.98 
 
 		 1024 aa  487  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  31.7 
 
 		 1076 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  31.72 
 
 		 1108 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  33.33 
 
 		 1031 aa  486  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  33.04 
 
 		 1024 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.04 
 
 		 1024 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  32.98 
 
 		 1041 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 		 1045 aa  482  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.27 
 
 		 1264 aa  481  1e-134  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1024 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  33.37 
 
 		 1024 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  33.33 
 
 		 1024 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  33.24 
 
 		 1024 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  32.85 
 
 		 1024 aa  477  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  33.4 
 
 		 1050 aa  475  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  41.05 
 
 		 628 aa  474  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  33.3 
 
 		 1066 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  33.4 
 
 		 1066 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  30.82 
 
 		 1032 aa  476  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.37 
 
 		 1041 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  32.98 
 
 		 1028 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32 
 
 		 1030 aa  465  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.5 
 
 		 1033 aa  465  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.03 
 
 		 1053 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.54 
 
 		 1030 aa  466  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  31.36 
 
 		 1030 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  31.04 
 
 		 1112 aa  461  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  34.33 
 
 		 1043 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  32.4 
 
 		 1032 aa  462  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1030 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.23 
 
 		 1030 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  32.85 
 
 		 1030 aa  459  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.26 
 
 		 1030 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.16 
 
 		 1030 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.26 
 
 		 1030 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  31.23 
 
 		 1030 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.67 
 
 		 1030 aa  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  33.93 
 
 		 1003 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  33.97 
 
 		 1043 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  33.59 
 
 		 1036 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.63 
 
 		 1036 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  32.11 
 
 		 1017 aa  442  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.77 
 
 		 1289 aa  442  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.08 
 
 		 1018 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.75 
 
 		 1004 aa  432  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.86 
 
 		 968 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.79 
 
 		 1329 aa  428  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  33.2 
 
 		 1020 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  32.89 
 
 		 1043 aa  426  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  29.39 
 
 		 1012 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  29.45 
 
 		 1009 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  37.39 
 
 		 1036 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.52 
 
 		 992 aa  416  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 		 1020 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.17 
 
 		 996 aa  399  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33 
 
 		 992 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  29.02 
 
 		 1021 aa  392  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.19 
 
 		 1003 aa  339  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 1022 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.82 
 
 		 1424 aa  313  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 		 1017 aa  247  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.95 
 
 		 1600 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  35.93 
 
 		 349 aa  185  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.01 
 
 		 972 aa  160  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.73 
 
 		 920 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.2 
 
 		 920 aa  144  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2026  glycoside hydrolase family 42 protein  32.27 
 
 		 326 aa  142  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 		 987 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.45 
 
 		 596 aa  128  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.38 
 
 		 607 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>