281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0539 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 913 aa  1892    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.62 
 
 		 781 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 781 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  32.35 
 
 		 785 aa  337  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  32.66 
 
 		 766 aa  335  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  31.52 
 
 		 763 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  29.41 
 
 		 750 aa  289  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  27.88 
 
 		 743 aa  276  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 979 aa  271  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.6 
 
 		 741 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  23.69 
 
 		 804 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  23.46 
 
 		 804 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 754 aa  193  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.91 
 
 		 748 aa  190  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.6 
 
 		 747 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.59 
 
 		 805 aa  181  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 832 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  31.69 
 
 		 894 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 		 807 aa  174  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  26.02 
 
 		 1015 aa  173  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  26.24 
 
 		 928 aa  173  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.98 
 
 		 862 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.24 
 
 		 811 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.53 
 
 		 986 aa  166  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.8 
 
 		 858 aa  165  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 		 803 aa  164  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  27.29 
 
 		 984 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  26.09 
 
 		 891 aa  160  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.01 
 
 		 805 aa  158  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  31.08 
 
 		 704 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.97 
 
 		 925 aa  157  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 806 aa  157  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.88 
 
 		 1041 aa  157  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  24.47 
 
 		 1355 aa  157  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 		 806 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 		 888 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  31.74 
 
 		 873 aa  155  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  25.4 
 
 		 897 aa  155  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.97 
 
 		 1781 aa  153  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  26.8 
 
 		 859 aa  152  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  23.14 
 
 		 932 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  29.76 
 
 		 707 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  29.21 
 
 		 815 aa  147  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.6 
 
 		 837 aa  146  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  26.36 
 
 		 1084 aa  145  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 1084 aa  144  8e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  23.91 
 
 		 848 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  27.42 
 
 		 563 aa  142  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 825 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.97 
 
 		 922 aa  141  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  25.65 
 
 		 964 aa  140  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 827 aa  140  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.56 
 
 		 972 aa  138  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 1094 aa  137  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.27 
 
 		 824 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  28.04 
 
 		 1019 aa  137  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  27.81 
 
 		 564 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.44 
 
 		 813 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  29.87 
 
 		 799 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  25.11 
 
 		 1063 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.01 
 
 		 968 aa  132  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 		 1079 aa  131  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.25 
 
 		 808 aa  130  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.47 
 
 		 1003 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  31.13 
 
 		 829 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.51 
 
 		 1289 aa  130  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.71 
 
 		 794 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  28.96 
 
 		 686 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  29.4 
 
 		 655 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.95 
 
 		 903 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  27.95 
 
 		 717 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  23.72 
 
 		 1455 aa  129  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.22 
 
 		 738 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 1049 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 		 919 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  30.22 
 
 		 987 aa  125  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.56 
 
 		 1026 aa  124  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.9 
 
 		 787 aa  124  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  28.81 
 
 		 598 aa  124  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.34 
 
 		 1264 aa  124  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  27.2 
 
 		 1020 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.06 
 
 		 1035 aa  123  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.09 
 
 		 1035 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 		 1043 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  26.5 
 
 		 1023 aa  122  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  26.51 
 
 		 1043 aa  122  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.03 
 
 		 1033 aa  121  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  26.3 
 
 		 1032 aa  119  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  26.87 
 
 		 1164 aa  118  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  25.69 
 
 		 1026 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  28.17 
 
 		 1041 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  24.22 
 
 		 1108 aa  117  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.2 
 
 		 598 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.22 
 
 		 1013 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  26.35 
 
 		 1044 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.14 
 
 		 1424 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  26.1 
 
 		 1003 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  27.49 
 
 		 1017 aa  115  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.77 
 
 		 992 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 		 951 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>