286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2111 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 
787 aa  1597    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.05 
 
 
805 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  38.24 
 
 
1015 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  38.36 
 
 
928 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  33.96 
 
 
827 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.29 
 
 
811 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  33.62 
 
 
806 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 
807 aa  449  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  33.66 
 
 
859 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  33.64 
 
 
1355 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.62 
 
 
794 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  31.23 
 
 
806 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  34.32 
 
 
815 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 
858 aa  432  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.21 
 
 
813 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.3 
 
 
986 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  35.27 
 
 
873 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.35 
 
 
1781 aa  406  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.71 
 
 
903 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.23 
 
 
922 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 
832 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.39 
 
 
837 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  33.41 
 
 
891 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 
1185 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.35 
 
 
808 aa  361  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.29 
 
 
824 aa  352  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 
984 aa  350  8e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  31.81 
 
 
925 aa  340  7e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  30.66 
 
 
961 aa  334  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 
932 aa  323  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  44.55 
 
 
919 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 
825 aa  317  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 
799 aa  316  9e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  31.31 
 
 
964 aa  316  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.68 
 
 
805 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.65 
 
 
1093 aa  298  4e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  30.62 
 
 
829 aa  293  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.16 
 
 
882 aa  292  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  33.28 
 
 
604 aa  270  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.51 
 
 
750 aa  221  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 
655 aa  218  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 
979 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 
888 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.65 
 
 
743 aa  191  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  30.38 
 
 
862 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  26.3 
 
 
763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.03 
 
 
858 aa  181  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.26 
 
 
766 aa  177  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.9 
 
 
704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.56 
 
 
707 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  24.54 
 
 
897 aa  170  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.39 
 
 
972 aa  167  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.17 
 
 
894 aa  165  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.41 
 
 
1019 aa  155  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 
803 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  25.07 
 
 
785 aa  152  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  28.82 
 
 
1129 aa  147  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.65 
 
 
1033 aa  144  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 
781 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.03 
 
 
747 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
754 aa  140  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  28.18 
 
 
1017 aa  138  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  29.44 
 
 
1063 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.77 
 
 
748 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.78 
 
 
781 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  22.04 
 
 
848 aa  137  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  28.1 
 
 
1044 aa  137  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.23 
 
 
824 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.75 
 
 
1264 aa  136  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 
1049 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  30.68 
 
 
1043 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.84 
 
 
913 aa  136  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  26.09 
 
 
1108 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  26.6 
 
 
1059 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  29.85 
 
 
1020 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 
1079 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.68 
 
 
1171 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  26.56 
 
 
1112 aa  131  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.06 
 
 
1026 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
1077 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.41 
 
 
804 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  27.29 
 
 
804 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  28.42 
 
 
889 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.03 
 
 
686 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  29.28 
 
 
1028 aa  128  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 
1043 aa  128  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.5 
 
 
1289 aa  128  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.39 
 
 
1030 aa  127  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  23.97 
 
 
1455 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.41 
 
 
1041 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  28.07 
 
 
738 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.77 
 
 
1030 aa  127  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.23 
 
 
1033 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.04 
 
 
1036 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.77 
 
 
1030 aa  126  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  28.75 
 
 
563 aa  125  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.55 
 
 
1030 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.55 
 
 
1030 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  27.55 
 
 
1030 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.55 
 
 
1030 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>