296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2520 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
925 aa  1914    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  49.51 
 
 
932 aa  900    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  46.55 
 
 
984 aa  885    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  46.99 
 
 
832 aa  672    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.61 
 
 
805 aa  595  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  36.83 
 
 
961 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  35.24 
 
 
1015 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  36.31 
 
 
964 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  34.83 
 
 
827 aa  452  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  36.15 
 
 
928 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  35.59 
 
 
873 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.74 
 
 
805 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  35.59 
 
 
806 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 
919 aa  422  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.13 
 
 
986 aa  411  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.29 
 
 
903 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.77 
 
 
922 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.56 
 
 
794 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.12 
 
 
813 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  30.86 
 
 
1355 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  30.97 
 
 
891 aa  347  6e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.15 
 
 
1781 aa  347  8.999999999999999e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.02 
 
 
811 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 
807 aa  340  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.8 
 
 
824 aa  333  7.000000000000001e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.81 
 
 
787 aa  331  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  30.9 
 
 
815 aa  324  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  28.13 
 
 
858 aa  317  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  28.38 
 
 
859 aa  313  6.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  30.2 
 
 
1185 aa  299  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 
806 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.3 
 
 
808 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  28.59 
 
 
829 aa  272  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.81 
 
 
837 aa  268  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  34.14 
 
 
604 aa  267  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
825 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 
799 aa  248  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.64 
 
 
1093 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.96 
 
 
862 aa  218  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.27 
 
 
743 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  25.93 
 
 
897 aa  210  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.24 
 
 
750 aa  206  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 
803 aa  204  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 
766 aa  204  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  25.55 
 
 
707 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.83 
 
 
858 aa  189  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 
655 aa  187  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  25.74 
 
 
704 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 
781 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.47 
 
 
882 aa  182  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.5 
 
 
781 aa  180  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  31.48 
 
 
804 aa  180  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  25.93 
 
 
894 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  31.09 
 
 
804 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 
979 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 
888 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.34 
 
 
748 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  24.61 
 
 
824 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.22 
 
 
747 aa  168  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25 
 
 
717 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.01 
 
 
738 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.68 
 
 
1171 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25.65 
 
 
763 aa  161  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.97 
 
 
913 aa  157  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  31.76 
 
 
972 aa  157  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  28.28 
 
 
686 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 
951 aa  149  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.79 
 
 
1033 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.78 
 
 
1129 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 
754 aa  147  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  22.45 
 
 
848 aa  146  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  29.2 
 
 
1043 aa  144  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  30.88 
 
 
1017 aa  143  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  40.41 
 
 
233 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  28.19 
 
 
1020 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.51 
 
 
1026 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 
987 aa  139  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  26.12 
 
 
1108 aa  139  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.82 
 
 
1036 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  29.63 
 
 
1063 aa  137  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  27.17 
 
 
1019 aa  137  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.24 
 
 
1035 aa  137  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  27.74 
 
 
1008 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.75 
 
 
920 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  26.04 
 
 
558 aa  135  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.7 
 
 
1289 aa  135  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  27.48 
 
 
1084 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 
1094 aa  135  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 
1175 aa  135  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.28 
 
 
1053 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 
1084 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.06 
 
 
1041 aa  133  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.35 
 
 
1329 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  29 
 
 
785 aa  132  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.61 
 
 
1264 aa  132  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  24.89 
 
 
1041 aa  132  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.95 
 
 
1035 aa  131  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 
1079 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.93 
 
 
1030 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.76 
 
 
1033 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>