293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3378 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  44.36 
 
 		 832 aa  698    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 984 aa  2038    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  47.93 
 
 		 932 aa  899    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  46.55 
 
 		 925 aa  885    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.52 
 
 		 805 aa  620  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  38.4 
 
 		 961 aa  525  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  34.72 
 
 		 964 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  37.77 
 
 		 827 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  36.49 
 
 		 806 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  35.6 
 
 		 1015 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.5 
 
 		 805 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  38.97 
 
 		 928 aa  452  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 		 873 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 		 919 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.41 
 
 		 922 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.79 
 
 		 903 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.98 
 
 		 986 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.66 
 
 		 813 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.55 
 
 		 824 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.66 
 
 		 1781 aa  391  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.48 
 
 		 794 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.95 
 
 		 811 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  30.87 
 
 		 891 aa  363  8e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  32.91 
 
 		 1355 aa  363  8e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 		 807 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 		 806 aa  341  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.04 
 
 		 787 aa  341  4e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 		 1185 aa  335  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  35.13 
 
 		 604 aa  317  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  28.91 
 
 		 859 aa  309  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 		 858 aa  303  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  29.33 
 
 		 815 aa  294  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.69 
 
 		 837 aa  283  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.51 
 
 		 808 aa  273  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 		 799 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 825 aa  259  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 829 aa  251  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.52 
 
 		 1093 aa  249  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  28.53 
 
 		 862 aa  241  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.71 
 
 		 897 aa  229  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  27.98 
 
 		 743 aa  222  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.32 
 
 		 882 aa  218  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.91 
 
 		 750 aa  218  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 		 655 aa  201  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 		 888 aa  198  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.56 
 
 		 858 aa  196  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 		 979 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 803 aa  188  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  22.33 
 
 		 781 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  23.58 
 
 		 785 aa  181  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  24.13 
 
 		 894 aa  181  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.92 
 
 		 717 aa  180  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.33 
 
 		 781 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  24.53 
 
 		 707 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  25.31 
 
 		 704 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.8 
 
 		 804 aa  164  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.29 
 
 		 913 aa  162  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.77 
 
 		 748 aa  160  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.61 
 
 		 972 aa  160  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  40.88 
 
 		 233 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.47 
 
 		 804 aa  158  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  22.93 
 
 		 848 aa  157  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.8 
 
 		 747 aa  155  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 766 aa  151  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  22.76 
 
 		 763 aa  151  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 951 aa  151  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  28.39 
 
 		 824 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.88 
 
 		 1035 aa  148  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 1175 aa  146  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  24.95 
 
 		 1019 aa  145  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  24.12 
 
 		 1129 aa  145  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.87 
 
 		 920 aa  144  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  27.41 
 
 		 1017 aa  144  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  27.53 
 
 		 1044 aa  144  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.47 
 
 		 1013 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.59 
 
 		 1026 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 		 1079 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  25.93 
 
 		 738 aa  141  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  26.4 
 
 		 1029 aa  141  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  29.22 
 
 		 512 aa  141  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  27.56 
 
 		 1024 aa  141  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 987 aa  140  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.25 
 
 		 1041 aa  141  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.52 
 
 		 1033 aa  140  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  29.43 
 
 		 1050 aa  140  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  29.43 
 
 		 1066 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  29.43 
 
 		 1066 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  25.58 
 
 		 558 aa  140  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25.64 
 
 		 1455 aa  140  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  24.48 
 
 		 1024 aa  138  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  26.02 
 
 		 1063 aa  137  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.35 
 
 		 686 aa  137  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  22.33 
 
 		 1077 aa  135  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.34 
 
 		 1171 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  29.19 
 
 		 564 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  29.38 
 
 		 563 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  24.63 
 
 		 598 aa  134  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.7 
 
 		 920 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  25.67 
 
 		 1108 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.95 
 
 		 1036 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>