290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4074 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  45.58 
 
 		 1015 aa  650    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  55.63 
 
 		 805 aa  910    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  47.19 
 
 		 928 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  52.09 
 
 		 827 aa  820    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 806 aa  1664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.42 
 
 		 813 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  39.74 
 
 		 922 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  38.7 
 
 		 919 aa  547  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  37.66 
 
 		 873 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  37.56 
 
 		 903 aa  535  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  37.81 
 
 		 1355 aa  535  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.85 
 
 		 824 aa  522  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.46 
 
 		 1781 aa  506  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.58 
 
 		 986 aa  495  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  35.96 
 
 		 891 aa  488  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  36.49 
 
 		 984 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.81 
 
 		 794 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  35.2 
 
 		 832 aa  472  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  35.12 
 
 		 1185 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.62 
 
 		 787 aa  457  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.28 
 
 		 805 aa  453  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.02 
 
 		 811 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  33.1 
 
 		 859 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  32.49 
 
 		 961 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.76 
 
 		 807 aa  438  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 806 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  35.59 
 
 		 925 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  39.08 
 
 		 604 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  32.25 
 
 		 858 aa  426  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  34.86 
 
 		 932 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  31.99 
 
 		 815 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.57 
 
 		 1093 aa  405  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  32.81 
 
 		 964 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.75 
 
 		 837 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 		 825 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 799 aa  357  5.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.94 
 
 		 808 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 829 aa  330  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.24 
 
 		 882 aa  290  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  31.19 
 
 		 655 aa  274  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.76 
 
 		 750 aa  249  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.89 
 
 		 897 aa  249  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.59 
 
 		 862 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 888 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.4 
 
 		 743 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.23 
 
 		 704 aa  220  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.4 
 
 		 707 aa  218  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 		 979 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.09 
 
 		 858 aa  209  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  25.3 
 
 		 894 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.89 
 
 		 717 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  31.36 
 
 		 803 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  25.15 
 
 		 848 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.93 
 
 		 1171 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  29.31 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 781 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.4 
 
 		 781 aa  167  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.96 
 
 		 1033 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  24.41 
 
 		 824 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  26.78 
 
 		 1043 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.53 
 
 		 913 aa  157  7e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  27.59 
 
 		 1112 aa  156  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  27.67 
 
 		 1044 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.33 
 
 		 804 aa  154  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.31 
 
 		 1030 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  26.81 
 
 		 1108 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  28.88 
 
 		 1019 aa  151  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.71 
 
 		 748 aa  151  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.33 
 
 		 804 aa  150  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.32 
 
 		 920 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 		 1175 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.2 
 
 		 747 aa  149  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 		 987 aa  148  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  26.26 
 
 		 1076 aa  147  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  24.94 
 
 		 1030 aa  147  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.17 
 
 		 1030 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  25.17 
 
 		 1030 aa  146  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.17 
 
 		 1030 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  28.26 
 
 		 785 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1030 aa  146  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  41.38 
 
 		 309 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  24.72 
 
 		 1030 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.17 
 
 		 1030 aa  145  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  34.91 
 
 		 233 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.17 
 
 		 1030 aa  145  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  26.3 
 
 		 601 aa  144  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  27.89 
 
 		 1024 aa  144  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 1077 aa  144  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.97 
 
 		 1129 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 		 1094 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 754 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  26.29 
 
 		 1059 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  26.99 
 
 		 1455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  27.07 
 
 		 1046 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  26.53 
 
 		 1084 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  25.27 
 
 		 1063 aa  141  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  27.11 
 
 		 1035 aa  140  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.87 
 
 		 607 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.58 
 
 		 1041 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  23.59 
 
 		 596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>