266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3160 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1185 aa  2474    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  37.39 
 
 		 1015 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  39.26 
 
 		 928 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 		 827 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.57 
 
 		 805 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.52 
 
 		 1781 aa  465  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.07 
 
 		 813 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  35.12 
 
 		 806 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  33.18 
 
 		 1355 aa  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.25 
 
 		 824 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  33.25 
 
 		 919 aa  440  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 		 873 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.21 
 
 		 986 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.3 
 
 		 922 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.5 
 
 		 903 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  33.62 
 
 		 891 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.21 
 
 		 787 aa  360  6e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  36.92 
 
 		 604 aa  358  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 807 aa  353  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  30.71 
 
 		 961 aa  351  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.36 
 
 		 805 aa  348  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  29.62 
 
 		 806 aa  347  6e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.86 
 
 		 1093 aa  343  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 832 aa  339  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.64 
 
 		 794 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 		 984 aa  335  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 858 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.84 
 
 		 811 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 		 932 aa  325  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.84 
 
 		 815 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 825 aa  320  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  30.41 
 
 		 964 aa  308  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  30.2 
 
 		 925 aa  299  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.39 
 
 		 837 aa  297  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  27.63 
 
 		 859 aa  288  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 		 829 aa  284  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.57 
 
 		 808 aa  282  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 799 aa  278  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.99 
 
 		 882 aa  248  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 655 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.58 
 
 		 862 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.16 
 
 		 743 aa  170  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 		 803 aa  164  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  23.96 
 
 		 848 aa  164  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  29.08 
 
 		 824 aa  157  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.61 
 
 		 858 aa  154  8e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.15 
 
 		 717 aa  151  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 		 979 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 888 aa  140  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  25.22 
 
 		 894 aa  136  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.15 
 
 		 1026 aa  134  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  23.06 
 
 		 781 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  24.16 
 
 		 707 aa  134  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  23.24 
 
 		 763 aa  134  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.36 
 
 		 1019 aa  132  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.6 
 
 		 972 aa  132  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  22.15 
 
 		 785 aa  131  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  21.38 
 
 		 766 aa  131  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.57 
 
 		 1129 aa  131  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.41 
 
 		 750 aa  130  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.03 
 
 		 781 aa  129  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  27.08 
 
 		 804 aa  126  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  25.46 
 
 		 738 aa  126  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  27.08 
 
 		 804 aa  125  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 1079 aa  124  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.78 
 
 		 1424 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  24.03 
 
 		 1171 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  25.99 
 
 		 599 aa  122  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  27.27 
 
 		 600 aa  122  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  27.27 
 
 		 1008 aa  121  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.12 
 
 		 1033 aa  121  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  25.98 
 
 		 1041 aa  120  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.07 
 
 		 923 aa  119  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.93 
 
 		 704 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  26.77 
 
 		 1108 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 		 987 aa  118  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  24.95 
 
 		 596 aa  118  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  27.05 
 
 		 1059 aa  118  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  24.72 
 
 		 603 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  30.84 
 
 		 233 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25 
 
 		 1005 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  24.69 
 
 		 686 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.3 
 
 		 1289 aa  115  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  27.76 
 
 		 1084 aa  115  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  27.08 
 
 		 1066 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.03 
 
 		 1030 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  27.08 
 
 		 1050 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  27.08 
 
 		 1066 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  24.63 
 
 		 1032 aa  112  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  26.49 
 
 		 564 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  27.72 
 
 		 1024 aa  112  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  27.01 
 
 		 889 aa  111  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  23.41 
 
 		 897 aa  111  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.62 
 
 		 607 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.15 
 
 		 1013 aa  111  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  26.93 
 
 		 1044 aa  110  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 1017 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 1049 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 1084 aa  110  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 754 aa  110  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>