More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1285 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  100 
 
 		 824 aa  1716    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  50.52 
 
 		 803 aa  783    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  36.02 
 
 		 848 aa  502  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  31.34 
 
 		 862 aa  324  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  29.47 
 
 		 894 aa  277  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  30.17 
 
 		 707 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  29.04 
 
 		 704 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  28.36 
 
 		 888 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.56 
 
 		 897 aa  245  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  28.62 
 
 		 717 aa  222  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.32 
 
 		 805 aa  218  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  28.32 
 
 		 928 aa  215  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.7 
 
 		 607 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  27.37 
 
 		 1015 aa  210  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 		 827 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.12 
 
 		 805 aa  207  8e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 932 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  25.78 
 
 		 600 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.96 
 
 		 1171 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 806 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 		 598 aa  191  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  27.32 
 
 		 587 aa  188  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.71 
 
 		 750 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  26 
 
 		 591 aa  185  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  27.18 
 
 		 597 aa  184  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  24.27 
 
 		 743 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 979 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  29.44 
 
 		 785 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 858 aa  178  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.02 
 
 		 625 aa  177  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  26.08 
 
 		 604 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  27.65 
 
 		 568 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 781 aa  171  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 		 766 aa  171  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.61 
 
 		 925 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.95 
 
 		 813 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.55 
 
 		 811 aa  168  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.68 
 
 		 858 aa  166  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.88 
 
 		 824 aa  166  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 		 806 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  26.8 
 
 		 670 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.29 
 
 		 1781 aa  164  6e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  24.67 
 
 		 763 aa  164  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.02 
 
 		 781 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 		 832 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.25 
 
 		 922 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 		 1175 aa  161  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.77 
 
 		 837 aa  161  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.54 
 
 		 986 aa  160  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  29.55 
 
 		 804 aa  160  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 807 aa  160  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 987 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  29.35 
 
 		 1019 aa  159  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.37 
 
 		 603 aa  158  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.29 
 
 		 903 aa  157  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 		 1185 aa  157  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.7 
 
 		 794 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.7 
 
 		 748 aa  156  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 919 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.92 
 
 		 972 aa  154  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  31.52 
 
 		 1049 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  28.47 
 
 		 804 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30 
 
 		 920 aa  152  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  26.07 
 
 		 558 aa  151  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.04 
 
 		 747 aa  151  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 		 984 aa  150  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  25.58 
 
 		 891 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 951 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  26.85 
 
 		 815 aa  147  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.97 
 
 		 920 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  26.04 
 
 		 859 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 754 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.73 
 
 		 808 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.86 
 
 		 686 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.24 
 
 		 1093 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  30.03 
 
 		 1046 aa  140  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.25 
 
 		 1033 aa  140  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  29.37 
 
 		 1024 aa  139  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.5 
 
 		 1424 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  28.53 
 
 		 1108 aa  139  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.27 
 
 		 741 aa  138  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  25.13 
 
 		 564 aa  138  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  24.96 
 
 		 563 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  25 
 
 		 964 aa  137  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.27 
 
 		 913 aa  137  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.86 
 
 		 787 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  31.51 
 
 		 1023 aa  134  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.22 
 
 		 1026 aa  134  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  26.22 
 
 		 1035 aa  133  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  25.71 
 
 		 1355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 873 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  28.25 
 
 		 1455 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  23.95 
 
 		 596 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  27.92 
 
 		 1045 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  26.84 
 
 		 1059 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.65 
 
 		 1030 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.38 
 
 		 577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.65 
 
 		 1030 aa  129  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 1077 aa  129  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  25.78 
 
 		 590 aa  128  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>