More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4075 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  53.31 
 
 
1171 aa  1283    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1175 aa  2424    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.79 
 
 
862 aa  253  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.42 
 
 
805 aa  201  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.09 
 
 
897 aa  194  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 
803 aa  190  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 
813 aa  185  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 
873 aa  177  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  24.1 
 
 
894 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.14 
 
 
986 aa  174  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.89 
 
 
743 aa  173  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  23.13 
 
 
888 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  26.79 
 
 
928 aa  171  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.41 
 
 
750 aa  168  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.76 
 
 
824 aa  167  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  27.37 
 
 
859 aa  164  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.29 
 
 
794 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  24.44 
 
 
891 aa  163  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 
1015 aa  161  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 
827 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 
806 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.68 
 
 
805 aa  155  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
984 aa  155  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  24.27 
 
 
704 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 
806 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  24.93 
 
 
919 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.45 
 
 
824 aa  152  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 
781 aa  151  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  25.21 
 
 
848 aa  151  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.99 
 
 
922 aa  150  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.93 
 
 
781 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  25.53 
 
 
707 aa  150  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  26.33 
 
 
1355 aa  148  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 
932 aa  148  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  27.59 
 
 
964 aa  148  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 
807 aa  147  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 
925 aa  146  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 
832 aa  146  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.26 
 
 
587 aa  146  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.44 
 
 
858 aa  145  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.33 
 
 
837 aa  145  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  23.23 
 
 
961 aa  144  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  26.98 
 
 
889 aa  143  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  25.26 
 
 
785 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.65 
 
 
811 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  23.03 
 
 
717 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  24.43 
 
 
804 aa  135  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.68 
 
 
1781 aa  134  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.01 
 
 
903 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  24.18 
 
 
804 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.74 
 
 
815 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 
858 aa  132  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.62 
 
 
1093 aa  127  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  24.68 
 
 
607 aa  125  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 
825 aa  124  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  22.66 
 
 
979 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 
598 aa  122  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  24.95 
 
 
1455 aa  121  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  21.13 
 
 
763 aa  119  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  24.84 
 
 
1063 aa  119  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 
1185 aa  118  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.7 
 
 
808 aa  118  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.5 
 
 
568 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.56 
 
 
787 aa  116  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.62 
 
 
1033 aa  115  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  25.45 
 
 
1041 aa  114  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.21 
 
 
1129 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.72 
 
 
892 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.44 
 
 
799 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 
829 aa  114  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.54 
 
 
623 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  23.88 
 
 
575 aa  112  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.88 
 
 
884 aa  112  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  23.9 
 
 
1024 aa  112  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.72 
 
 
1033 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.76 
 
 
913 aa  110  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  24.14 
 
 
972 aa  108  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  23.14 
 
 
1020 aa  108  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 
655 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  24.05 
 
 
670 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  23.82 
 
 
1032 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  25.09 
 
 
563 aa  107  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  23.99 
 
 
600 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  22.91 
 
 
590 aa  105  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.59 
 
 
609 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  23.8 
 
 
597 aa  105  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 
1043 aa  105  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.78 
 
 
738 aa  104  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.9 
 
 
1041 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  23.24 
 
 
591 aa  103  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  23.3 
 
 
601 aa  103  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  24.04 
 
 
1044 aa  103  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  24.56 
 
 
564 aa  103  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.09 
 
 
1026 aa  103  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  24.37 
 
 
625 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  25.59 
 
 
603 aa  102  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  21.24 
 
 
766 aa  102  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  23.39 
 
 
1084 aa  101  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  22.6 
 
 
799 aa  101  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 
1084 aa  100  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>