More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1017 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  100 
 
 		 717 aa  1471    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  45.39 
 
 		 888 aa  604  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  42.68 
 
 		 897 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  42.52 
 
 		 704 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  41.02 
 
 		 707 aa  495  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  34.57 
 
 		 862 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  32.15 
 
 		 894 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 803 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  27.9 
 
 		 824 aa  227  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  26.07 
 
 		 848 aa  207  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  29.24 
 
 		 964 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 806 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  24.72 
 
 		 806 aa  187  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  28.52 
 
 		 558 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 		 984 aa  180  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.48 
 
 		 805 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  30.13 
 
 		 670 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  25.2 
 
 		 928 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  23.59 
 
 		 961 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.72 
 
 		 805 aa  170  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  24.35 
 
 		 1015 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 807 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  25.04 
 
 		 925 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 781 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.4 
 
 		 1171 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.97 
 
 		 813 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.29 
 
 		 858 aa  162  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.31 
 
 		 596 aa  162  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 873 aa  160  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.75 
 
 		 922 aa  160  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.74 
 
 		 811 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.08 
 
 		 986 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.2 
 
 		 785 aa  160  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.72 
 
 		 781 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 932 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  28.82 
 
 		 590 aa  157  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  27.18 
 
 		 587 aa  157  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  26.74 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  26.36 
 
 		 591 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  25.61 
 
 		 564 aa  156  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 832 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 827 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 919 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  26.42 
 
 		 607 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  27.93 
 
 		 568 aa  153  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.34 
 
 		 603 aa  153  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  25.61 
 
 		 563 aa  153  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 1185 aa  152  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25.66 
 
 		 763 aa  150  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 858 aa  150  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.53 
 
 		 824 aa  149  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.69 
 
 		 1781 aa  149  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  27.61 
 
 		 597 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  24.76 
 
 		 588 aa  145  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  23.74 
 
 		 1355 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 		 979 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.46 
 
 		 577 aa  143  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  23.08 
 
 		 600 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.71 
 
 		 903 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  24.36 
 
 		 891 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 		 598 aa  141  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 766 aa  140  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.96 
 
 		 750 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  24.77 
 
 		 743 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  28.16 
 
 		 604 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  22.54 
 
 		 1175 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 		 987 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.61 
 
 		 644 aa  137  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.64 
 
 		 686 aa  137  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  24.58 
 
 		 599 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  22.82 
 
 		 859 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  27.13 
 
 		 804 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.33 
 
 		 804 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.85 
 
 		 625 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  26.23 
 
 		 1041 aa  129  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.95 
 
 		 913 aa  129  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  23.7 
 
 		 677 aa  127  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.13 
 
 		 1093 aa  127  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.66 
 
 		 794 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  26.54 
 
 		 603 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.78 
 
 		 815 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  26.69 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  26.69 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.69 
 
 		 603 aa  125  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.69 
 
 		 603 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.69 
 
 		 603 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.26 
 
 		 738 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.83 
 
 		 1030 aa  124  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.18 
 
 		 598 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.52 
 
 		 603 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.55 
 
 		 1033 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.52 
 
 		 603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.59 
 
 		 1035 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.21 
 
 		 972 aa  122  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  23.17 
 
 		 601 aa  122  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.03 
 
 		 920 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  26.07 
 
 		 512 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.94 
 
 		 837 aa  121  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.91 
 
 		 1030 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  26.34 
 
 		 603 aa  120  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>