292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5245 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  100 
 
 
670 aa  1353    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.59 
 
 
603 aa  214  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  29.7 
 
 
607 aa  207  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  29.48 
 
 
597 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  30.22 
 
 
587 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  30.57 
 
 
625 aa  200  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  31.24 
 
 
604 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.8 
 
 
600 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 
598 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  26.5 
 
 
591 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 
888 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  29.49 
 
 
568 aa  184  7e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  30.13 
 
 
717 aa  177  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  28.21 
 
 
596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.88 
 
 
897 aa  174  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  26.86 
 
 
603 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.39 
 
 
707 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.56 
 
 
704 aa  170  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  27.68 
 
 
677 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.6 
 
 
686 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.18 
 
 
644 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.71 
 
 
824 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  27.26 
 
 
599 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.34 
 
 
803 aa  164  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.11 
 
 
738 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  29.37 
 
 
590 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  27.08 
 
 
603 aa  160  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  27.08 
 
 
603 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.44 
 
 
603 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.44 
 
 
603 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  27.98 
 
 
558 aa  158  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.21 
 
 
603 aa  158  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  26.6 
 
 
603 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  26.6 
 
 
603 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  26.12 
 
 
603 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.91 
 
 
894 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.68 
 
 
862 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.65 
 
 
598 aa  147  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  25.1 
 
 
577 aa  147  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  24.45 
 
 
588 aa  145  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  24.2 
 
 
601 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  28.6 
 
 
815 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  23.19 
 
 
848 aa  144  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  25.47 
 
 
563 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  26.54 
 
 
512 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 
919 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.85 
 
 
743 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.17 
 
 
986 aa  137  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  26.79 
 
 
598 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.52 
 
 
811 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  25.47 
 
 
564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  26.35 
 
 
1015 aa  135  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  23.55 
 
 
1355 aa  134  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  26.56 
 
 
928 aa  134  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.48 
 
 
972 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  27.46 
 
 
859 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.94 
 
 
805 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  26.21 
 
 
1041 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  27.25 
 
 
785 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 
827 aa  127  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  28.07 
 
 
763 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.25 
 
 
922 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.08 
 
 
750 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  26.04 
 
 
1032 aa  124  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.92 
 
 
903 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.23 
 
 
1108 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 
807 aa  121  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  30.2 
 
 
889 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.67 
 
 
781 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 
984 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 
781 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 
806 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.21 
 
 
787 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.39 
 
 
923 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.53 
 
 
1036 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.79 
 
 
794 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  25.66 
 
 
1084 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  24.62 
 
 
1019 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.07 
 
 
813 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  28.33 
 
 
891 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25 
 
 
1030 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  25 
 
 
1030 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25 
 
 
1030 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  25 
 
 
1030 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25 
 
 
1030 aa  117  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25 
 
 
1030 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.05 
 
 
1289 aa  117  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 
1084 aa  117  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 
925 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25 
 
 
1030 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.76 
 
 
858 aa  115  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  24.84 
 
 
1030 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  27.08 
 
 
1044 aa  115  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  28.03 
 
 
1024 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
806 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  23.98 
 
 
1043 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.49 
 
 
808 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.47 
 
 
1093 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.22 
 
 
837 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.95 
 
 
1171 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>