More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1177 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  100 
 
 		 859 aa  1775    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  40.72 
 
 		 858 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 		 807 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  36.39 
 
 		 806 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 		 806 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.66 
 
 		 787 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  32.69 
 
 		 1015 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.23 
 
 		 805 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  32.33 
 
 		 928 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 827 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.86 
 
 		 811 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.36 
 
 		 794 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  30.57 
 
 		 1355 aa  361  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.25 
 
 		 813 aa  360  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  30.78 
 
 		 832 aa  359  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  29.38 
 
 		 961 aa  355  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.68 
 
 		 1781 aa  355  2.9999999999999997e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  31.26 
 
 		 815 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 919 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 		 932 aa  341  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.4 
 
 		 922 aa  340  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 873 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.44 
 
 		 824 aa  334  5e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.37 
 
 		 986 aa  332  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.6 
 
 		 837 aa  332  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  29.99 
 
 		 891 aa  324  3e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.6 
 
 		 903 aa  317  5e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 925 aa  313  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 		 984 aa  309  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 		 825 aa  298  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 799 aa  297  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.3 
 
 		 805 aa  294  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 829 aa  291  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 		 1185 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.46 
 
 		 808 aa  282  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  28.55 
 
 		 964 aa  263  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.16 
 
 		 1093 aa  261  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.27 
 
 		 882 aa  241  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 655 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  28.35 
 
 		 604 aa  217  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  24.29 
 
 		 897 aa  193  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.4 
 
 		 750 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  29.9 
 
 		 862 aa  185  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.58 
 
 		 858 aa  185  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  23.55 
 
 		 743 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  30.34 
 
 		 972 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  24.82 
 
 		 707 aa  177  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 		 803 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 781 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 979 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  29.2 
 
 		 704 aa  171  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.79 
 
 		 781 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  28.74 
 
 		 763 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 766 aa  164  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 888 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  23.65 
 
 		 894 aa  162  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 1175 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.06 
 
 		 1171 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.8 
 
 		 913 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  29.61 
 
 		 804 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  28.88 
 
 		 804 aa  149  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.04 
 
 		 824 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.39 
 
 		 1033 aa  144  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 1049 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  28.67 
 
 		 1129 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  27.57 
 
 		 785 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  28.14 
 
 		 1108 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  22.68 
 
 		 717 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.58 
 
 		 747 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  28.15 
 
 		 1084 aa  134  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 1079 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 		 1084 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  28.83 
 
 		 1024 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  26.13 
 
 		 1017 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.39 
 
 		 1264 aa  132  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.04 
 
 		 1019 aa  130  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  36.63 
 
 		 309 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.48 
 
 		 1018 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.43 
 
 		 920 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  28.4 
 
 		 670 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.69 
 
 		 1053 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  26.46 
 
 		 1063 aa  129  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.83 
 
 		 1013 aa  128  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.86 
 
 		 1036 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  29.43 
 
 		 607 aa  127  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.84 
 
 		 748 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 1043 aa  126  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.93 
 
 		 1026 aa  125  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.18 
 
 		 1033 aa  125  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  27.58 
 
 		 1094 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  24.89 
 
 		 1112 aa  124  8e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.24 
 
 		 738 aa  124  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.23 
 
 		 1041 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.75 
 
 		 741 aa  120  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  28.07 
 
 		 1032 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 987 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  29.38 
 
 		 597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  25.93 
 
 		 587 aa  119  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 598 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25 
 
 		 1455 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>