More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0857 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  60.62 
 
 
808 aa  1024    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 
837 aa  1716    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.03 
 
 
794 aa  549  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 
799 aa  544  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.77 
 
 
811 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  34.66 
 
 
825 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  36.62 
 
 
829 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  34.3 
 
 
815 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.61 
 
 
805 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.21 
 
 
882 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 
873 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 
807 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.39 
 
 
787 aa  372  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  29.75 
 
 
806 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 
919 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  30.36 
 
 
827 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.37 
 
 
986 aa  362  1e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  28.77 
 
 
1015 aa  362  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 
806 aa  360  8e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  29.19 
 
 
928 aa  357  5e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.58 
 
 
922 aa  343  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  29.65 
 
 
1355 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  30.25 
 
 
891 aa  340  5e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 
832 aa  335  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.03 
 
 
813 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  29.6 
 
 
859 aa  332  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 
858 aa  327  7e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.8 
 
 
824 aa  322  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  33.27 
 
 
655 aa  318  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.36 
 
 
805 aa  308  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.48 
 
 
1781 aa  308  2.0000000000000002e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 
1185 aa  297  7e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.55 
 
 
1093 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  28.94 
 
 
961 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
932 aa  285  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 
984 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 
925 aa  268  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  29.3 
 
 
964 aa  263  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  30.74 
 
 
604 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.62 
 
 
903 aa  241  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.68 
 
 
743 aa  204  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.9 
 
 
858 aa  191  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.62 
 
 
862 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  29.05 
 
 
750 aa  181  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  28.77 
 
 
824 aa  161  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  31.25 
 
 
804 aa  157  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
781 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 
803 aa  155  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.4 
 
 
781 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  28.33 
 
 
894 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.93 
 
 
748 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  31.15 
 
 
804 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.48 
 
 
747 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.6 
 
 
913 aa  146  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 
754 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.92 
 
 
897 aa  139  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  28.93 
 
 
785 aa  138  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  23.3 
 
 
707 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 
766 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 
1175 aa  135  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  28.87 
 
 
563 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 
888 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  28.71 
 
 
564 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.91 
 
 
741 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.89 
 
 
1026 aa  131  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.07 
 
 
704 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  29.62 
 
 
738 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  26.67 
 
 
601 aa  127  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  26.08 
 
 
979 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  26.73 
 
 
1035 aa  127  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.41 
 
 
1171 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.84 
 
 
686 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.62 
 
 
1019 aa  123  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 
987 aa  122  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
951 aa  122  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.94 
 
 
717 aa  120  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.08 
 
 
577 aa  120  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  29.84 
 
 
607 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  26.68 
 
 
512 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.86 
 
 
892 aa  118  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  27.01 
 
 
587 aa  117  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  28.57 
 
 
1024 aa  117  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  24.41 
 
 
1020 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.42 
 
 
972 aa  117  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  23.53 
 
 
848 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.91 
 
 
1030 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  27.16 
 
 
1030 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.91 
 
 
1030 aa  115  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.55 
 
 
1030 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 
598 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  26.67 
 
 
1030 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  26.67 
 
 
1030 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.67 
 
 
1030 aa  114  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.67 
 
 
1030 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  24.22 
 
 
670 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.78 
 
 
1041 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.67 
 
 
1030 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  26.26 
 
 
1076 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  25.28 
 
 
1043 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  22.62 
 
 
1112 aa  110  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>