296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2447 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  100 
 
 		 677 aa  1402    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  28.44 
 
 		 587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  29.08 
 
 		 1063 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  27.99 
 
 		 590 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.54 
 
 		 686 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  28.14 
 
 		 558 aa  171  5e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  27.68 
 
 		 670 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  25.52 
 
 		 644 aa  164  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.81 
 
 		 738 aa  164  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  27.35 
 
 		 604 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.42 
 
 		 607 aa  157  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  26.92 
 
 		 598 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  24.96 
 
 		 591 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  23.42 
 
 		 598 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.48 
 
 		 707 aa  154  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  28.39 
 
 		 597 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  26.24 
 
 		 1108 aa  151  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 1045 aa  150  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.94 
 
 		 1129 aa  150  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  25.48 
 
 		 568 aa  150  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.86 
 
 		 1289 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  26.38 
 
 		 596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  25.48 
 
 		 603 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  25.48 
 
 		 603 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  27.88 
 
 		 1076 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  25.32 
 
 		 603 aa  147  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  25.16 
 
 		 603 aa  147  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 		 803 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  25.37 
 
 		 563 aa  146  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  25.16 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  25.16 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  23.23 
 
 		 601 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  23.88 
 
 		 897 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  25.16 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  25.16 
 
 		 603 aa  145  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  25.15 
 
 		 1045 aa  144  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  25.59 
 
 		 1455 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  25.25 
 
 		 599 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.54 
 
 		 1033 aa  143  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.97 
 
 		 598 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.16 
 
 		 862 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 1049 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  25.24 
 
 		 564 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.93 
 
 		 1036 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  25.25 
 
 		 625 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.84 
 
 		 1019 aa  140  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 1079 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  24.05 
 
 		 1046 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  24.96 
 
 		 704 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.49 
 
 		 1035 aa  138  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  25.93 
 
 		 603 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  24.34 
 
 		 1084 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.53 
 
 		 1030 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1030 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  25.53 
 
 		 1030 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  24.12 
 
 		 603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.53 
 
 		 1030 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  25.29 
 
 		 588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.53 
 
 		 1030 aa  135  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.43 
 
 		 1035 aa  135  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.53 
 
 		 1030 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 1077 aa  135  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.53 
 
 		 1030 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  25.45 
 
 		 1059 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.53 
 
 		 1030 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  26.32 
 
 		 1017 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  24.44 
 
 		 894 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 		 1084 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  24.66 
 
 		 1112 aa  130  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  25.98 
 
 		 1032 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.53 
 
 		 992 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  25.97 
 
 		 1044 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  26.58 
 
 		 889 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.22 
 
 		 1041 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  21.21 
 
 		 600 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  23.7 
 
 		 717 aa  127  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.62 
 
 		 1424 aa  127  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.5 
 
 		 1053 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 		 888 aa  126  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.75 
 
 		 903 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 925 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  26.98 
 
 		 1023 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 1043 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.56 
 
 		 824 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  25.59 
 
 		 1024 aa  124  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  25.7 
 
 		 1003 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.59 
 
 		 805 aa  123  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  26.56 
 
 		 891 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.22 
 
 		 1018 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.08 
 
 		 577 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.37 
 
 		 1264 aa  121  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 1094 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.8 
 
 		 1026 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.29 
 
 		 923 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  23.6 
 
 		 1021 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  25.68 
 
 		 1024 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.55 
 
 		 968 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  25.34 
 
 		 1032 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25 
 
 		 763 aa  119  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.34 
 
 		 986 aa  117  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>