273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0711 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 626 aa  1304    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  45.24 
 
 		 584 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.75 
 
 		 932 aa  532  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  45.33 
 
 		 600 aa  523  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  41.85 
 
 		 602 aa  459  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.54 
 
 		 619 aa  451  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  38.88 
 
 		 603 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.29 
 
 		 614 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40 
 
 		 614 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.17 
 
 		 800 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.21 
 
 		 905 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.52 
 
 		 884 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37 
 
 		 620 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  36.85 
 
 		 640 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.05 
 
 		 799 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.96 
 
 		 901 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.41 
 
 		 609 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.89 
 
 		 757 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.88 
 
 		 575 aa  360  3e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.39 
 
 		 864 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.03 
 
 		 1064 aa  346  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.39 
 
 		 623 aa  337  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  33.44 
 
 		 980 aa  331  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  31.5 
 
 		 613 aa  308  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 593 aa  246  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.62 
 
 		 595 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.42 
 
 		 590 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 		 623 aa  237  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.57 
 
 		 614 aa  230  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 		 645 aa  229  8e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 		 627 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.75 
 
 		 614 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.17 
 
 		 640 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.44 
 
 		 621 aa  220  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.76 
 
 		 892 aa  207  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.61 
 
 		 604 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  27.07 
 
 		 889 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.74 
 
 		 651 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 945 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.25 
 
 		 710 aa  170  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.99 
 
 		 923 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.79 
 
 		 619 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  22.15 
 
 		 568 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  24.09 
 
 		 1084 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  24.59 
 
 		 1045 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 1084 aa  89.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  22.08 
 
 		 925 aa  87.4  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  21.12 
 
 		 929 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.49 
 
 		 808 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.31 
 
 		 598 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.13 
 
 		 744 aa  85.1  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  21.23 
 
 		 587 aa  84.7  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  26.87 
 
 		 750 aa  84  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  21.83 
 
 		 734 aa  84  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.4 
 
 		 837 aa  84  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  24.23 
 
 		 600 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  24.58 
 
 		 1035 aa  82  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  22.97 
 
 		 607 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  20.36 
 
 		 590 aa  81.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  25.42 
 
 		 1035 aa  80.9  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  25.1 
 
 		 1032 aa  80.1  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.4 
 
 		 858 aa  79.3  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  23.32 
 
 		 738 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  23 
 
 		 596 aa  79  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  24.64 
 
 		 597 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  22.78 
 
 		 591 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  23.37 
 
 		 1129 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  24.34 
 
 		 1036 aa  77.4  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  23.62 
 
 		 766 aa  77.4  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  23.76 
 
 		 563 aa  77  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  22 
 
 		 686 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.65 
 
 		 1026 aa  76.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  22.54 
 
 		 972 aa  75.1  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  24.31 
 
 		 1024 aa  73.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  22.51 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  24.79 
 
 		 763 aa  73.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  23.76 
 
 		 1017 aa  72.8  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  23.01 
 
 		 940 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.59 
 
 		 1108 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  22.95 
 
 		 815 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.84 
 
 		 1013 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  23.1 
 
 		 1041 aa  71.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  22.12 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  22.12 
 
 		 1063 aa  71.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  24.37 
 
 		 1029 aa  71.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  20.62 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  22.89 
 
 		 984 aa  71.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  23.84 
 
 		 932 aa  71.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  20.72 
 
 		 644 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  20.07 
 
 		 577 aa  70.5  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  23.19 
 
 		 1019 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  24.7 
 
 		 1031 aa  70.1  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  24 
 
 		 564 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  20.77 
 
 		 628 aa  70.1  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  22.54 
 
 		 804 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  22.72 
 
 		 804 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  21.65 
 
 		 1026 aa  68.6  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.06 
 
 		 1033 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.86 
 
 		 748 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.56 
 
 		 813 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>