278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2483 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  55.63 
 
 
593 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
623 aa  1271    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  56.29 
 
 
627 aa  636    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  55.5 
 
 
595 aa  650    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  60.07 
 
 
640 aa  718    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  47.85 
 
 
604 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  43.57 
 
 
710 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  39.69 
 
 
590 aa  458  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  38.9 
 
 
645 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.39 
 
 
614 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  41.13 
 
 
614 aa  359  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  38.87 
 
 
651 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.01 
 
 
621 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.22 
 
 
884 aa  294  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 
603 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.83 
 
 
614 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.05 
 
 
620 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.62 
 
 
614 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.55 
 
 
799 aa  270  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  36.73 
 
 
575 aa  269  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.24 
 
 
602 aa  266  8e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.72 
 
 
800 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.44 
 
 
932 aa  254  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.6 
 
 
905 aa  253  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.16 
 
 
609 aa  247  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.15 
 
 
864 aa  243  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.13 
 
 
757 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.06 
 
 
623 aa  240  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.98 
 
 
640 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.14 
 
 
892 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 
626 aa  237  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.39 
 
 
619 aa  237  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.21 
 
 
1064 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.6 
 
 
901 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  31 
 
 
889 aa  221  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  30.16 
 
 
600 aa  216  9e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.49 
 
 
980 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  32.85 
 
 
584 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  31.82 
 
 
613 aa  206  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 
945 aa  203  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.59 
 
 
923 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.71 
 
 
619 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.8 
 
 
743 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.45 
 
 
750 aa  124  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  26.65 
 
 
603 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  25.19 
 
 
590 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  27.93 
 
 
603 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  26.06 
 
 
598 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.31 
 
 
644 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.25 
 
 
577 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  26.44 
 
 
607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.83 
 
 
972 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.94 
 
 
862 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.16 
 
 
598 aa  111  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.17 
 
 
603 aa  110  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.17 
 
 
603 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.17 
 
 
603 aa  110  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.17 
 
 
603 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  25.93 
 
 
603 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  23.97 
 
 
600 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  23.94 
 
 
1044 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.42 
 
 
837 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  25.79 
 
 
603 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  26.64 
 
 
604 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  27.8 
 
 
1029 aa  105  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  25.75 
 
 
603 aa  104  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  25.75 
 
 
603 aa  104  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  25.18 
 
 
1032 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.47 
 
 
625 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  24.87 
 
 
1066 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  27.69 
 
 
587 aa  102  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  24.87 
 
 
1050 aa  102  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  24.87 
 
 
1066 aa  102  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  25 
 
 
785 aa  101  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.86 
 
 
808 aa  100  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  22.49 
 
 
598 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 
916 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.65 
 
 
986 aa  98.2  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25.31 
 
 
804 aa  97.4  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  24.33 
 
 
1036 aa  97.4  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  28.61 
 
 
568 aa  97.1  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  25.51 
 
 
1024 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25.31 
 
 
804 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.66 
 
 
596 aa  96.3  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  25 
 
 
591 aa  94.7  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  24.81 
 
 
1031 aa  94.4  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  24.7 
 
 
1036 aa  94.4  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  23.63 
 
 
1019 aa  94.4  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  22.57 
 
 
601 aa  93.6  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  22.79 
 
 
1028 aa  93.6  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  21.93 
 
 
827 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 
873 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25 
 
 
1129 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  25 
 
 
597 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.22 
 
 
1033 aa  91.3  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 
734 aa  90.9  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  26.3 
 
 
815 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 
914 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.49 
 
 
811 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.11 
 
 
858 aa  89.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>