254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  100 
 
 		 710 aa  1390    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.74 
 
 		 640 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  45.55 
 
 		 627 aa  509  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  42.95 
 
 		 593 aa  498  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  43.51 
 
 		 623 aa  475  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.07 
 
 		 595 aa  465  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  43.55 
 
 		 604 aa  412  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.62 
 
 		 590 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  36.76 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.07 
 
 		 621 aa  322  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  36.73 
 
 		 614 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.95 
 
 		 614 aa  306  9.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.18 
 
 		 651 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.37 
 
 		 575 aa  234  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.28 
 
 		 905 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.84 
 
 		 614 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.36 
 
 		 640 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.55 
 
 		 892 aa  224  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.78 
 
 		 864 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.31 
 
 		 800 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.35 
 
 		 799 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.47 
 
 		 884 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.14 
 
 		 1064 aa  214  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  27.43 
 
 		 603 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.56 
 
 		 609 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.64 
 
 		 620 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.85 
 
 		 623 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.88 
 
 		 757 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.76 
 
 		 932 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.83 
 
 		 980 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.03 
 
 		 602 aa  197  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  32.84 
 
 		 889 aa  195  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.41 
 
 		 901 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.02 
 
 		 619 aa  188  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  29.67 
 
 		 584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.89 
 
 		 614 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 626 aa  180  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 945 aa  178  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  25.45 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.82 
 
 		 923 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  27.13 
 
 		 613 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.28 
 
 		 619 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.99 
 
 		 587 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  22.87 
 
 		 743 aa  100  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  22.57 
 
 		 600 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.25 
 
 		 811 aa  94.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  27.57 
 
 		 598 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  24.75 
 
 		 928 aa  92.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  22.86 
 
 		 598 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.33 
 
 		 785 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.56 
 
 		 607 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  23.68 
 
 		 750 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  28 
 
 		 568 aa  89.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  25.31 
 
 		 815 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  28.21 
 
 		 670 aa  88.2  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  27.69 
 
 		 1028 aa  87.8  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  23.88 
 
 		 824 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.05 
 
 		 972 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.89 
 
 		 1171 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  23.2 
 
 		 804 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  28.29 
 
 		 1063 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.67 
 
 		 794 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.65 
 
 		 805 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.59 
 
 		 862 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 		 734 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  22.07 
 
 		 1019 aa  84.3  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  26.94 
 
 		 891 aa  84  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 766 aa  84  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 		 1077 aa  84  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  24.74 
 
 		 1036 aa  83.2  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 		 1020 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  26.1 
 
 		 590 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  24.39 
 
 		 596 aa  81.6  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.34 
 
 		 968 aa  81.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  21.38 
 
 		 1045 aa  81.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  24.62 
 
 		 894 aa  81.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  22.51 
 
 		 804 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  23.96 
 
 		 644 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  23.64 
 
 		 597 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  21.74 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  23.73 
 
 		 951 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.77 
 
 		 808 aa  79  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.6 
 
 		 787 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  24.14 
 
 		 1015 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  24.09 
 
 		 599 aa  78.2  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.05 
 
 		 748 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 		 873 aa  77.8  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.21 
 
 		 837 aa  77  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.71 
 
 		 940 aa  77  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.8 
 
 		 1424 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  25 
 
 		 964 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.49 
 
 		 747 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  27.04 
 
 		 707 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.55 
 
 		 1033 aa  76.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  21.83 
 
 		 1129 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  22.76 
 
 		 1175 aa  75.1  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  20.2 
 
 		 827 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  24.17 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.1 
 
 		 704 aa  73.9  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.81 
 
 		 986 aa  74.3  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>