285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0966 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  67.65 
 
 		 614 aa  794    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  65.68 
 
 		 614 aa  777    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 621 aa  1256    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  57.39 
 
 		 651 aa  671    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  37.75 
 
 		 627 aa  333  7.000000000000001e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.01 
 
 		 590 aa  333  7.000000000000001e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  38.01 
 
 		 623 aa  328  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.2 
 
 		 595 aa  323  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  36.19 
 
 		 593 aa  316  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  37.07 
 
 		 710 aa  310  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.53 
 
 		 640 aa  309  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  35.66 
 
 		 645 aa  293  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  36.71 
 
 		 604 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.97 
 
 		 623 aa  264  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  36.82 
 
 		 575 aa  263  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.85 
 
 		 1064 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.33 
 
 		 799 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.81 
 
 		 905 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.88 
 
 		 884 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.32 
 
 		 800 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.9 
 
 		 614 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  34.72 
 
 		 980 aa  247  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.85 
 
 		 609 aa  247  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.95 
 
 		 620 aa  246  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.62 
 
 		 901 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.07 
 
 		 602 aa  237  5.0000000000000005e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 		 603 aa  233  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.15 
 
 		 757 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.54 
 
 		 614 aa  230  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.28 
 
 		 932 aa  225  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.76 
 
 		 619 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  30.54 
 
 		 600 aa  220  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 		 626 aa  220  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.01 
 
 		 864 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.15 
 
 		 640 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  40.79 
 
 		 584 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  28.75 
 
 		 613 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.38 
 
 		 892 aa  186  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 945 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  30.17 
 
 		 889 aa  177  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.46 
 
 		 923 aa  174  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  28.32 
 
 		 598 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.61 
 
 		 738 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  29.57 
 
 		 815 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  27.73 
 
 		 590 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.71 
 
 		 603 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.27 
 
 		 603 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.27 
 
 		 603 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.27 
 
 		 603 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  26.05 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  26.05 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.27 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  26.05 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.05 
 
 		 686 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.16 
 
 		 858 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  25.39 
 
 		 603 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  24.39 
 
 		 785 aa  107  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.2 
 
 		 837 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  26.18 
 
 		 607 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.13 
 
 		 929 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.4 
 
 		 598 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.12 
 
 		 619 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  24.18 
 
 		 596 aa  100  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  25 
 
 		 644 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.54 
 
 		 811 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.13 
 
 		 805 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.29 
 
 		 747 aa  97.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  22.42 
 
 		 1043 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  23.02 
 
 		 598 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  23.43 
 
 		 601 aa  95.5  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.23 
 
 		 748 aa  95.5  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.22 
 
 		 577 aa  95.1  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  23.59 
 
 		 600 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.36 
 
 		 1033 aa  93.2  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.43 
 
 		 704 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.29 
 
 		 587 aa  91.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.25 
 
 		 787 aa  91.3  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 754 aa  90.9  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25.56 
 
 		 763 aa  90.5  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.13 
 
 		 743 aa  90.5  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 		 925 aa  90.5  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  27.54 
 
 		 707 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  23.74 
 
 		 1015 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  25.06 
 
 		 1063 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  27.22 
 
 		 604 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.32 
 
 		 794 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.49 
 
 		 744 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.71 
 
 		 1781 aa  89  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  22.71 
 
 		 806 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  24.4 
 
 		 1045 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.57 
 
 		 717 aa  88.2  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  24.48 
 
 		 625 aa  87.8  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  22.16 
 
 		 1019 aa  87.4  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  28.3 
 
 		 964 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.53 
 
 		 1088 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 832 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.23 
 
 		 862 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.53 
 
 		 1018 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.47 
 
 		 972 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  26.49 
 
 		 597 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>