242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0309 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  100 
 
 		 604 aa  1177    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  47.07 
 
 		 623 aa  484  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.66 
 
 		 595 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.19 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  44.16 
 
 		 593 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  46.47 
 
 		 627 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  43.73 
 
 		 710 aa  405  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.12 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  37.6 
 
 		 645 aa  332  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.71 
 
 		 621 aa  279  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.55 
 
 		 614 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.98 
 
 		 614 aa  264  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.21 
 
 		 651 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  38.18 
 
 		 575 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.81 
 
 		 640 aa  247  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.1 
 
 		 620 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 603 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.37 
 
 		 614 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.39 
 
 		 602 aa  235  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.3 
 
 		 614 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.38 
 
 		 623 aa  234  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.18 
 
 		 1064 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.76 
 
 		 864 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.5 
 
 		 905 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.99 
 
 		 884 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  32.94 
 
 		 980 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.01 
 
 		 799 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.47 
 
 		 609 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.08 
 
 		 932 aa  210  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.65 
 
 		 757 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.06 
 
 		 800 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.98 
 
 		 892 aa  204  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  28.51 
 
 		 626 aa  203  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.14 
 
 		 901 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.33 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  28.25 
 
 		 600 aa  194  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  35.15 
 
 		 889 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  32.68 
 
 		 584 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  29.18 
 
 		 613 aa  185  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.62 
 
 		 923 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 		 945 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.16 
 
 		 619 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  23.47 
 
 		 743 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  24.4 
 
 		 785 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.21 
 
 		 750 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  24.46 
 
 		 607 aa  97.1  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  22.96 
 
 		 600 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  21.02 
 
 		 827 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  27.07 
 
 		 587 aa  95.1  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  27.95 
 
 		 964 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  26.48 
 
 		 590 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  24.74 
 
 		 1045 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.4 
 
 		 1063 aa  91.3  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 		 1077 aa  90.9  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.44 
 
 		 787 aa  90.5  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  22.58 
 
 		 598 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.78 
 
 		 972 aa  88.2  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.05 
 
 		 686 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  27.34 
 
 		 717 aa  87.8  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  25.22 
 
 		 738 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.28 
 
 		 625 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.84 
 
 		 858 aa  86.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 734 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 925 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 		 1045 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 		 1185 aa  84  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.15 
 
 		 808 aa  84  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.7 
 
 		 596 aa  83.2  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  23.64 
 
 		 1019 aa  82.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  27.46 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.79 
 
 		 922 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.7 
 
 		 1030 aa  82  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  25.36 
 
 		 815 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 		 1043 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 916 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.8 
 
 		 805 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 766 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  26.85 
 
 		 670 aa  79.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 		 914 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  23.69 
 
 		 591 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 803 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  27.16 
 
 		 891 aa  77.4  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.29 
 
 		 837 aa  77.4  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.15 
 
 		 913 aa  76.6  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 873 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  26.27 
 
 		 603 aa  76.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  25.12 
 
 		 1076 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  21.63 
 
 		 806 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  22.79 
 
 		 588 aa  75.9  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  22.62 
 
 		 1129 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  22.65 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.64 
 
 		 811 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.9 
 
 		 813 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  23.83 
 
 		 804 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  24.59 
 
 		 598 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  20.73 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  23.35 
 
 		 804 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  25.51 
 
 		 1028 aa  73.9  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  24.38 
 
 		 599 aa  73.6  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  23.96 
 
 		 862 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>