More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0006 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
734 aa  1524    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.22 
 
 
744 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 
724 aa  282  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 
739 aa  272  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.38 
 
 
720 aa  257  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  26.17 
 
 
813 aa  196  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.22 
 
 
813 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 
785 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
786 aa  169  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  26.29 
 
 
824 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 
891 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
906 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.25 
 
 
818 aa  144  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  24.78 
 
 
833 aa  144  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 
793 aa  142  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.08 
 
 
843 aa  140  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  25.26 
 
 
839 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  25.8 
 
 
823 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 
763 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.21 
 
 
817 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.62 
 
 
971 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  25.27 
 
 
860 aa  137  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  25.04 
 
 
891 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  25.83 
 
 
812 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 
863 aa  135  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  26.04 
 
 
846 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  24.49 
 
 
864 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  23.87 
 
 
837 aa  131  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.24 
 
 
835 aa  128  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.99 
 
 
984 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  25.88 
 
 
831 aa  125  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  23.09 
 
 
1144 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.21 
 
 
842 aa  124  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.09 
 
 
897 aa  124  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 
871 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.81 
 
 
845 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
888 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  23.85 
 
 
819 aa  120  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  23.2 
 
 
847 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  22.61 
 
 
861 aa  119  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.31 
 
 
1063 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.83 
 
 
862 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  23.47 
 
 
815 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  26.61 
 
 
1028 aa  117  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 
627 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  24.09 
 
 
840 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  26.18 
 
 
889 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 
803 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  28.05 
 
 
837 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.79 
 
 
1129 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.57 
 
 
811 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  27.76 
 
 
845 aa  114  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  25 
 
 
785 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  24.07 
 
 
838 aa  113  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.49 
 
 
872 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  23.96 
 
 
717 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  25.55 
 
 
1041 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.55 
 
 
1026 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25 
 
 
843 aa  112  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.83 
 
 
845 aa  112  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.65 
 
 
623 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.73 
 
 
972 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  25.77 
 
 
815 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.53 
 
 
878 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  23.96 
 
 
962 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  24.81 
 
 
829 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  26.68 
 
 
1036 aa  109  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  24.32 
 
 
1024 aa  109  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.35 
 
 
1033 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  24.09 
 
 
940 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.3 
 
 
750 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.92 
 
 
929 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  23.33 
 
 
1270 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.33 
 
 
858 aa  108  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  25.58 
 
 
819 aa  107  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.85 
 
 
781 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  28.73 
 
 
875 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  24.94 
 
 
859 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 
806 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.6 
 
 
743 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
987 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.54 
 
 
738 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 
827 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  22.7 
 
 
824 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  24.15 
 
 
819 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  25.17 
 
 
677 aa  105  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  25.67 
 
 
1044 aa  105  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  23.59 
 
 
824 aa  104  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.01 
 
 
892 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  25.78 
 
 
1032 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  26.95 
 
 
1030 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.16 
 
 
1019 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.23 
 
 
980 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 
781 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  26.95 
 
 
1030 aa  103  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.18 
 
 
757 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.5 
 
 
609 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 
1049 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  26.95 
 
 
1030 aa  103  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  24.95 
 
 
564 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>