249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0991 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 914 aa  1847    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  84.21 
 
 		 916 aa  1590    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.09 
 
 		 923 aa  161  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.47 
 
 		 929 aa  146  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  27.08 
 
 		 889 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.58 
 
 		 892 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 603 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 		 623 aa  96.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  23.53 
 
 		 601 aa  95.9  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.18 
 
 		 603 aa  95.5  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.18 
 
 		 623 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  26.04 
 
 		 558 aa  93.2  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.3 
 
 		 972 aa  92.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.94 
 
 		 707 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.25 
 
 		 800 aa  92.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.34 
 
 		 614 aa  91.3  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.58 
 
 		 590 aa  90.9  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.69 
 
 		 980 aa  90.9  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  25.34 
 
 		 813 aa  90.9  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  26.87 
 
 		 564 aa  90.5  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 		 1084 aa  89.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.62 
 
 		 602 aa  89.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  23.76 
 
 		 1084 aa  87.8  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  25.12 
 
 		 704 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24 
 
 		 640 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.67 
 
 		 905 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  26.62 
 
 		 563 aa  87.4  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  25.8 
 
 		 832 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.01 
 
 		 799 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.19 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.91 
 
 		 575 aa  87  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.77 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.16 
 
 		 757 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.76 
 
 		 864 aa  83.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  24.14 
 
 		 613 aa  82.8  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.9 
 
 		 884 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.95 
 
 		 587 aa  82.8  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  24.12 
 
 		 738 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.59 
 
 		 940 aa  82.4  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.53 
 
 		 805 aa  82.4  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.37 
 
 		 604 aa  82  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.96 
 
 		 619 aa  81.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.84 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.57 
 
 		 913 aa  81.3  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  27.55 
 
 		 604 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.42 
 
 		 1064 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.83 
 
 		 1018 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  25 
 
 		 859 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  24.94 
 
 		 686 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  24.94 
 
 		 597 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.89 
 
 		 717 aa  79.3  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.87 
 
 		 811 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 645 aa  79  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  23.95 
 
 		 607 aa  79  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.38 
 
 		 621 aa  79  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 		 987 aa  77.8  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  23.58 
 
 		 591 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  25.36 
 
 		 964 aa  77.4  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.69 
 
 		 901 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.71 
 
 		 951 aa  77.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  24.36 
 
 		 600 aa  77  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.62 
 
 		 619 aa  76.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3865  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.53 
 
 		 918 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.160045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.43 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.52 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 627 aa  75.5  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.81 
 
 		 932 aa  75.1  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  24.27 
 
 		 1171 aa  74.7  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.51 
 
 		 1003 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.26 
 
 		 614 aa  73.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.18 
 
 		 858 aa  73.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  20.69 
 
 		 577 aa  74.3  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.26 
 
 		 620 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  30.06 
 
 		 584 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26 
 
 		 824 aa  73.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.33 
 
 		 1088 aa  73.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  25.82 
 
 		 1063 aa  73.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.87 
 
 		 640 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.13 
 
 		 744 aa  73.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  23.6 
 
 		 750 aa  73.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  24 
 
 		 1020 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  21.29 
 
 		 1175 aa  71.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.45 
 
 		 1108 aa  71.2  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  22.07 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 766 aa  70.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  21.05 
 
 		 984 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  24.01 
 
 		 1043 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.19 
 
 		 920 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  27.36 
 
 		 1031 aa  69.7  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 724 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  24.37 
 
 		 603 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  24.66 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 806 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.47 
 
 		 651 aa  69.3  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  22.37 
 
 		 848 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  24.88 
 
 		 590 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  23.41 
 
 		 1030 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 888 aa  68.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  23.41 
 
 		 1030 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  23.41 
 
 		 1030 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>