250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1751 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 		 1088 aa  2208    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  39.27 
 
 		 951 aa  627  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3865  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.75 
 
 		 918 aa  569  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.160045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.04 
 
 		 1056 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3871  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.48 
 
 		 924 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3081  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 1149 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.92 
 
 		 929 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.96 
 
 		 923 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  25.44 
 
 		 738 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  25.26 
 
 		 587 aa  88.6  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.53 
 
 		 621 aa  86.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.3 
 
 		 785 aa  85.9  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  24.94 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  23.92 
 
 		 889 aa  84  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.82 
 
 		 614 aa  82.4  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.37 
 
 		 1036 aa  82  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  24.73 
 
 		 1063 aa  80.9  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  25.85 
 
 		 603 aa  80.1  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  21.1 
 
 		 1045 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.81 
 
 		 609 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.65 
 
 		 1064 aa  80.1  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  23.48 
 
 		 1059 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.02 
 
 		 1053 aa  78.2  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  22.36 
 
 		 1045 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.15 
 
 		 1424 aa  78.2  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  24.04 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  24.04 
 
 		 603 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  24.04 
 
 		 603 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  24.23 
 
 		 734 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  23.45 
 
 		 1028 aa  77.4  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  21 
 
 		 598 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  24.04 
 
 		 603 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  24.01 
 
 		 644 aa  76.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  24.04 
 
 		 603 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.19 
 
 		 858 aa  77  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.52 
 
 		 1264 aa  77  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  20.94 
 
 		 1084 aa  76.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  24.04 
 
 		 603 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  23.73 
 
 		 677 aa  76.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.21 
 
 		 1005 aa  76.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  23.97 
 
 		 590 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  25.13 
 
 		 1023 aa  75.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  24.21 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  21.66 
 
 		 1084 aa  75.9  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 1049 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  23.84 
 
 		 603 aa  75.5  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  22.22 
 
 		 1029 aa  75.5  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  22.46 
 
 		 607 aa  75.5  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  21 
 
 		 1043 aa  75.1  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  24.31 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  24.3 
 
 		 763 aa  74.7  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  24.31 
 
 		 980 aa  74.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  23.25 
 
 		 1032 aa  74.3  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.28 
 
 		 892 aa  73.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  23.64 
 
 		 603 aa  73.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 914 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 		 916 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.65 
 
 		 1033 aa  72.8  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  23.29 
 
 		 1076 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  22.54 
 
 		 686 aa  73.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  24.57 
 
 		 625 aa  72.4  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.37 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  22.34 
 
 		 597 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.71 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 		 945 aa  72  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  21.38 
 
 		 577 aa  72  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.77 
 
 		 781 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  21.65 
 
 		 1024 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  22.28 
 
 		 1031 aa  70.1  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 		 781 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  24.05 
 
 		 670 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 766 aa  69.3  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  24.36 
 
 		 815 aa  69.3  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.55 
 
 		 901 aa  69.3  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.26 
 
 		 1289 aa  68.9  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  20.82 
 
 		 1035 aa  68.6  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.19 
 
 		 623 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  21.6 
 
 		 1066 aa  68.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.48 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  21.6 
 
 		 1066 aa  68.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  21.6 
 
 		 1050 aa  68.2  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.56 
 
 		 913 aa  67.4  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  23.16 
 
 		 1023 aa  67.8  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  22.1 
 
 		 599 aa  67.4  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  22 
 
 		 707 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  19.82 
 
 		 1046 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.26 
 
 		 614 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  24.15 
 
 		 1036 aa  67.8  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.32 
 
 		 757 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  21.16 
 
 		 1019 aa  67  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.47 
 
 		 800 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  21.73 
 
 		 1041 aa  66.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  21.18 
 
 		 1108 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.88 
 
 		 805 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 644 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  23.29 
 
 		 1043 aa  64.7  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  22.7 
 
 		 1036 aa  64.7  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  20.37 
 
 		 1026 aa  64.3  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  19.71 
 
 		 803 aa  64.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  21.41 
 
 		 743 aa  64.3  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>