93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3081 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3081  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1149 aa  2390    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.69 
 
 		 1056 aa  463  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3871  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.5 
 
 		 924 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3865  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.77 
 
 		 918 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.160045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.1 
 
 		 1088 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.99 
 
 		 951 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.86 
 
 		 929 aa  333  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  25.64 
 
 		 738 aa  96.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.44 
 
 		 892 aa  94  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.04 
 
 		 923 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  22.54 
 
 		 686 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 803 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  22.92 
 
 		 596 aa  68.2  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  22.45 
 
 		 1046 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  23.36 
 
 		 785 aa  63.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  21.01 
 
 		 734 aa  63.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  23.43 
 
 		 781 aa  63.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  21.57 
 
 		 945 aa  62.4  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  20.85 
 
 		 603 aa  62  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  20.42 
 
 		 603 aa  61.6  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  22.37 
 
 		 1045 aa  61.6  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.14 
 
 		 781 aa  60.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  21.02 
 
 		 603 aa  61.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  20.42 
 
 		 603 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  20.64 
 
 		 603 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  20.64 
 
 		 603 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  20.51 
 
 		 603 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  20.51 
 
 		 603 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  22.16 
 
 		 766 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  20 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  21.22 
 
 		 1024 aa  58.2  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  21.9 
 
 		 1084 aa  57.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  22.91 
 
 		 1455 aa  57.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  21.73 
 
 		 1084 aa  57.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  22.66 
 
 		 603 aa  57.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  24.26 
 
 		 804 aa  56.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  21.28 
 
 		 604 aa  55.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  21.28 
 
 		 558 aa  55.5  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  21.21 
 
 		 1029 aa  54.3  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 		 984 aa  53.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  23.18 
 
 		 587 aa  53.5  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  22.35 
 
 		 1012 aa  53.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  27.54 
 
 		 601 aa  53.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  21.37 
 
 		 940 aa  52.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 		 627 aa  52.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  22.3 
 
 		 1020 aa  52.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  20.95 
 
 		 607 aa  52  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.35 
 
 		 1108 aa  51.6  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  21.86 
 
 		 1045 aa  51.6  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  23.31 
 
 		 568 aa  51.6  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.97 
 
 		 1003 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.82 
 
 		 1026 aa  50.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  20.66 
 
 		 1008 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  22.52 
 
 		 1024 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  23.73 
 
 		 743 aa  50.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  23.06 
 
 		 824 aa  50.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  21.9 
 
 		 889 aa  50.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  22.35 
 
 		 1024 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.09 
 
 		 858 aa  50.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  21.77 
 
 		 827 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  21.92 
 
 		 619 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  20.3 
 
 		 598 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  21.9 
 
 		 1024 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.9 
 
 		 1024 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  22.52 
 
 		 1024 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1024 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  21.39 
 
 		 763 aa  49.7  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  22.99 
 
 		 804 aa  50.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.03 
 
 		 992 aa  49.7  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  20.57 
 
 		 670 aa  49.3  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  21.45 
 
 		 644 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  21.96 
 
 		 1019 aa  49.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  27.33 
 
 		 577 aa  49.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.14 
 
 		 1004 aa  48.9  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  19.94 
 
 		 916 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  21.51 
 
 		 1063 aa  48.5  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  21.67 
 
 		 1024 aa  48.1  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.46 
 
 		 1264 aa  48.1  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  23.46 
 
 		 979 aa  48.1  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  22.22 
 
 		 1041 aa  48.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  22.83 
 
 		 603 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  19.26 
 
 		 1035 aa  47.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  21.49 
 
 		 1043 aa  46.6  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 		 739 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.03 
 
 		 1053 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  27.85 
 
 		 894 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  19.87 
 
 		 1066 aa  46.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  19.87 
 
 		 1050 aa  46.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  19.87 
 
 		 1066 aa  45.8  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.55 
 
 		 623 aa  45.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.22 
 
 		 968 aa  45.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  23.87 
 
 		 1031 aa  44.7  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  24.61 
 
 		 613 aa  44.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>