249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3865 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3871  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.77 
 
 		 924 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.58 
 
 		 1056 aa  668    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3865  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 918 aa  1904    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.160045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  36.11 
 
 		 951 aa  593  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.75 
 
 		 1088 aa  569  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3081  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 1149 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.89 
 
 		 929 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  24.41 
 
 		 738 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  22.1 
 
 		 1045 aa  105  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 803 aa  104  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  20.58 
 
 		 916 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  22.79 
 
 		 1046 aa  97.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.85 
 
 		 892 aa  95.9  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  23.19 
 
 		 889 aa  95.5  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.53 
 
 		 923 aa  93.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.23 
 
 		 619 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  23.82 
 
 		 1043 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 1077 aa  90.1  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  23.09 
 
 		 1059 aa  88.2  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  22.89 
 
 		 558 aa  88.6  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  21.19 
 
 		 614 aa  87.8  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.61 
 
 		 590 aa  87.8  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25.73 
 
 		 763 aa  86.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  22.88 
 
 		 785 aa  85.1  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  25.72 
 
 		 707 aa  85.1  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  21.6 
 
 		 603 aa  84.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  22.4 
 
 		 1108 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  22.28 
 
 		 827 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.73 
 
 		 805 aa  82.8  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  23.08 
 
 		 1084 aa  82.8  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  22.73 
 
 		 1084 aa  81.6  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  22.08 
 
 		 1112 aa  81.3  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.33 
 
 		 621 aa  81.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  22.02 
 
 		 590 aa  81.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  22.89 
 
 		 1079 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  23.28 
 
 		 1023 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  22.9 
 
 		 734 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  23.34 
 
 		 945 aa  79.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  22.22 
 
 		 1019 aa  78.2  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  23.74 
 
 		 815 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.32 
 
 		 824 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 825 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.45 
 
 		 1033 aa  76.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  22.37 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  20.89 
 
 		 1017 aa  76.3  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  22.62 
 
 		 651 aa  75.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.05 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  23.14 
 
 		 750 aa  75.5  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  22.38 
 
 		 686 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.92 
 
 		 986 aa  74.7  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  21.36 
 
 		 1045 aa  74.7  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.55 
 
 		 1004 aa  74.3  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.6 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  20.61 
 
 		 603 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  22.64 
 
 		 1129 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 		 627 aa  74.3  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  20.78 
 
 		 806 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  20.81 
 
 		 914 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  20.61 
 
 		 603 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 766 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  20.75 
 
 		 607 aa  73.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.67 
 
 		 1036 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.3 
 
 		 1018 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  22.56 
 
 		 1024 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  24.17 
 
 		 894 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.75 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.79 
 
 		 1026 aa  72.8  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.19 
 
 		 1329 aa  72.4  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.5 
 
 		 781 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  22.51 
 
 		 980 aa  72.4  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  23.19 
 
 		 1003 aa  72  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  23.03 
 
 		 597 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  22.32 
 
 		 972 aa  71.6  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  20.79 
 
 		 1063 aa  71.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  20.45 
 
 		 1076 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  22.64 
 
 		 781 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  20.61 
 
 		 603 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  20.61 
 
 		 603 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  23.65 
 
 		 625 aa  71.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.45 
 
 		 858 aa  71.2  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.25 
 
 		 837 aa  70.5  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 		 984 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 951 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  20.74 
 
 		 603 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  20.2 
 
 		 603 aa  69.7  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  20.41 
 
 		 603 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  22.01 
 
 		 704 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 799 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  21.32 
 
 		 598 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  20.41 
 
 		 603 aa  69.7  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  23.27 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  22.91 
 
 		 1028 aa  68.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  21.06 
 
 		 604 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  21.88 
 
 		 859 aa  68.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  22.25 
 
 		 670 aa  67.8  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.91 
 
 		 813 aa  67.8  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 		 1020 aa  67.8  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 873 aa  67.8  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  21.44 
 
 		 600 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>