207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3896 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  100 
 
 		 951 aa  1937    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.27 
 
 		 1088 aa  627  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3865  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.11 
 
 		 918 aa  593  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.160045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.45 
 
 		 1056 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3871  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.86 
 
 		 924 aa  538  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.85 
 
 		 929 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3081  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 		 1149 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.45 
 
 		 923 aa  124  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  25.84 
 
 		 738 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.88 
 
 		 980 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.43 
 
 		 1033 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.25 
 
 		 892 aa  99.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  26.98 
 
 		 889 aa  95.9  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  26.82 
 
 		 1063 aa  91.3  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  23.84 
 
 		 686 aa  90.9  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.46 
 
 		 614 aa  89.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  22.93 
 
 		 1059 aa  88.2  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  20.6 
 
 		 600 aa  87.8  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.93 
 
 		 805 aa  84  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  23.85 
 
 		 1084 aa  84.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  22.98 
 
 		 916 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.81 
 
 		 800 aa  82.8  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 		 1084 aa  82.8  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  22.82 
 
 		 815 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.74 
 
 		 614 aa  82.4  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  21.88 
 
 		 785 aa  81.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.24 
 
 		 799 aa  81.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 		 1077 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  25.27 
 
 		 677 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.65 
 
 		 905 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  24.64 
 
 		 575 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  23.62 
 
 		 600 aa  79  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.39 
 
 		 901 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  21.17 
 
 		 607 aa  78.2  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  21.77 
 
 		 1076 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.22 
 
 		 794 aa  78.2  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.59 
 
 		 621 aa  77.8  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.63 
 
 		 805 aa  77.8  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  23.95 
 
 		 587 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 914 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  21.76 
 
 		 598 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.26 
 
 		 609 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.85 
 
 		 932 aa  75.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 		 1043 aa  75.5  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  24.09 
 
 		 1355 aa  74.7  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.5 
 
 		 640 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  23.31 
 
 		 603 aa  73.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  22.89 
 
 		 734 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.72 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  24.73 
 
 		 625 aa  73.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.55 
 
 		 747 aa  72.8  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  22.14 
 
 		 1046 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.77 
 
 		 781 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.16 
 
 		 803 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.14 
 
 		 757 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  23.64 
 
 		 763 aa  72.4  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  22.82 
 
 		 597 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  21.74 
 
 		 1108 aa  71.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 781 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 		 925 aa  71.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.23 
 
 		 748 aa  71.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.47 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  21.85 
 
 		 984 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  24.63 
 
 		 590 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.17 
 
 		 1053 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  21.8 
 
 		 928 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  21.74 
 
 		 1035 aa  70.5  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.77 
 
 		 623 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  22.1 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  23.23 
 
 		 591 aa  68.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  23.53 
 
 		 864 aa  68.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  22.61 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 		 1079 aa  67.4  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  23.12 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  22.82 
 
 		 1017 aa  66.6  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  22.75 
 
 		 1045 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.99 
 
 		 619 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.72 
 
 		 620 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  24.94 
 
 		 972 aa  66.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  21.91 
 
 		 1455 aa  65.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  23.87 
 
 		 1015 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.6 
 
 		 1329 aa  65.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  21.98 
 
 		 827 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  20.58 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.6 
 
 		 1064 aa  65.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 		 627 aa  65.1  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  21.57 
 
 		 806 aa  65.1  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  21.35 
 
 		 945 aa  65.1  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.43 
 
 		 884 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.7 
 
 		 1036 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.98 
 
 		 604 aa  65.1  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.91 
 
 		 986 aa  65.1  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 		 754 aa  64.7  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  22.46 
 
 		 1049 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  20.32 
 
 		 563 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  23.19 
 
 		 568 aa  63.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  21.67 
 
 		 859 aa  63.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  22.9 
 
 		 603 aa  62.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  21.35 
 
 		 1094 aa  62.4  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>