More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2021 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
724 aa  1489    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  86.43 
 
 
739 aa  1318    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  54.86 
 
 
720 aa  805    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  33.07 
 
 
734 aa  280  5e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.88 
 
 
744 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 
786 aa  145  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  25.16 
 
 
813 aa  144  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  23.7 
 
 
837 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 
785 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.54 
 
 
845 aa  130  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 
871 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.02 
 
 
971 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.32 
 
 
835 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 
906 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2707  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.89 
 
 
624 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.37 
 
 
845 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.74 
 
 
872 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  28.75 
 
 
889 aa  124  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  25.18 
 
 
875 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  22.71 
 
 
793 aa  120  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.06 
 
 
609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.01 
 
 
984 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.72 
 
 
842 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  24.01 
 
 
864 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 
763 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  24.29 
 
 
815 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.64 
 
 
813 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  25.98 
 
 
819 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  21.84 
 
 
837 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  25.89 
 
 
860 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.13 
 
 
923 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 
863 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.03 
 
 
878 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  23.53 
 
 
862 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  24.68 
 
 
940 aa  107  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  23.87 
 
 
861 aa  107  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  25.48 
 
 
802 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.04 
 
 
826 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  25.32 
 
 
819 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 
897 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  25.91 
 
 
840 aa  104  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  26.08 
 
 
607 aa  104  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  27.79 
 
 
839 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.33 
 
 
892 aa  104  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  25.38 
 
 
558 aa  103  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  24.49 
 
 
819 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  27.25 
 
 
568 aa  102  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 
853 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  25.33 
 
 
591 aa  101  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  26.58 
 
 
831 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  25 
 
 
802 aa  101  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  28.32 
 
 
829 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  28.57 
 
 
799 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  24.96 
 
 
812 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  26.79 
 
 
833 aa  97.8  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.04 
 
 
826 aa  97.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  26.18 
 
 
962 aa  97.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.47 
 
 
972 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  25.88 
 
 
587 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  24.09 
 
 
882 aa  95.5  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  24.53 
 
 
707 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  27.17 
 
 
824 aa  94.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 
663 aa  94  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.77 
 
 
858 aa  94  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  26.15 
 
 
811 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.4 
 
 
818 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  24.06 
 
 
823 aa  92  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 
781 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  23.55 
 
 
880 aa  91.3  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.21 
 
 
757 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 
803 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  22.59 
 
 
1270 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  32.11 
 
 
940 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.71 
 
 
781 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  25.11 
 
 
597 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.91 
 
 
623 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  24.37 
 
 
677 aa  88.2  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  24.18 
 
 
785 aa  87.8  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  25.43 
 
 
891 aa  87.8  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  25.99 
 
 
846 aa  87  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  26.24 
 
 
824 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.4 
 
 
1171 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.97 
 
 
805 aa  86.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  22.99 
 
 
824 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.61 
 
 
817 aa  85.5  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  23.65 
 
 
598 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.89 
 
 
609 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 
891 aa  84.7  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  22.92 
 
 
596 aa  85.1  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.48 
 
 
686 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  23.48 
 
 
897 aa  85.1  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  25.04 
 
 
828 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  25.04 
 
 
828 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  25.04 
 
 
828 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  24.09 
 
 
839 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  23.62 
 
 
856 aa  83.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  24.22 
 
 
845 aa  83.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.53 
 
 
794 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.54 
 
 
811 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.36 
 
 
884 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>