58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0813 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  48.2 
 
 		 841 aa  746    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  47.37 
 
 		 833 aa  735    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 786 aa  1639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  49.29 
 
 		 825 aa  765    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  48.19 
 
 		 822 aa  734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  63.92 
 
 		 802 aa  1055    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  46.16 
 
 		 868 aa  690    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  41.54 
 
 		 816 aa  590  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  40.77 
 
 		 825 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  39.07 
 
 		 864 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  41.73 
 
 		 842 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  40.49 
 
 		 768 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.79 
 
 		 1094 aa  560  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  38.72 
 
 		 781 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  38.92 
 
 		 811 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  39.09 
 
 		 741 aa  524  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.32 
 
 		 784 aa  521  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  37.32 
 
 		 790 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  40.42 
 
 		 759 aa  515  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  39.25 
 
 		 1193 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  36.94 
 
 		 747 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  37.62 
 
 		 824 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  41.29 
 
 		 940 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  37.04 
 
 		 778 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  34.79 
 
 		 1139 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 		 835 aa  482  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  39.73 
 
 		 1479 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  36.07 
 
 		 757 aa  476  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  34.98 
 
 		 856 aa  465  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  36.08 
 
 		 1164 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  36.01 
 
 		 742 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  35.74 
 
 		 991 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.16 
 
 		 781 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  35.95 
 
 		 758 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  34.44 
 
 		 803 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  33.81 
 
 		 809 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  34.63 
 
 		 760 aa  426  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  32.13 
 
 		 837 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  32.82 
 
 		 796 aa  386  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  42.74 
 
 		 646 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  31.6 
 
 		 831 aa  349  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  32.81 
 
 		 808 aa  338  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  30.61 
 
 		 762 aa  332  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  30.24 
 
 		 773 aa  310  6.999999999999999e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  29.87 
 
 		 788 aa  303  8.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  39.44 
 
 		 819 aa  294  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  30.57 
 
 		 943 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.08 
 
 		 809 aa  280  9e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  28.26 
 
 		 804 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  25.26 
 
 		 809 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  22.95 
 
 		 770 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  28.79 
 
 		 757 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  26.73 
 
 		 753 aa  104  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  30.77 
 
 		 262 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  51.06 
 
 		 116 aa  99.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  25.3 
 
 		 750 aa  88.6  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  31.77 
 
 		 928 aa  57.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  30.56 
 
 		 1148 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>