62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3112 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  45.99 
 
 		 868 aa  724    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  48.19 
 
 		 786 aa  734    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  55.07 
 
 		 825 aa  927    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  54.13 
 
 		 833 aa  890    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  42.16 
 
 		 864 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  51.27 
 
 		 841 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  48.29 
 
 		 802 aa  748    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  100 
 
 		 822 aa  1704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  41.62 
 
 		 825 aa  631  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  40.58 
 
 		 842 aa  609  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  42.75 
 
 		 816 aa  600  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.25 
 
 		 1094 aa  591  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  42.23 
 
 		 811 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  41.27 
 
 		 759 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  41.31 
 
 		 741 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  41.47 
 
 		 768 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 		 781 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  39.25 
 
 		 778 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.24 
 
 		 784 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  37.56 
 
 		 824 aa  535  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  39.37 
 
 		 790 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  38.64 
 
 		 747 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 		 835 aa  521  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  38.29 
 
 		 1193 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  37.73 
 
 		 991 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  39.13 
 
 		 1164 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  43.03 
 
 		 940 aa  509  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  36.02 
 
 		 1139 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  38.81 
 
 		 1479 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  34.38 
 
 		 809 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  35.82 
 
 		 781 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  36.12 
 
 		 803 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  35.63 
 
 		 757 aa  466  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  37.83 
 
 		 742 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  35.29 
 
 		 856 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  34.66 
 
 		 837 aa  462  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  35.07 
 
 		 758 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  33.38 
 
 		 760 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  32.31 
 
 		 762 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  32.15 
 
 		 796 aa  376  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  33.76 
 
 		 831 aa  363  7.0000000000000005e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  32.45 
 
 		 808 aa  347  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  30.24 
 
 		 819 aa  345  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  39.11 
 
 		 646 aa  335  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  29.27 
 
 		 788 aa  334  4e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  28.87 
 
 		 773 aa  306  8.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.92 
 
 		 809 aa  289  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  26.96 
 
 		 804 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  26.88 
 
 		 943 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  26.56 
 
 		 809 aa  201  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  24.64 
 
 		 753 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  23.61 
 
 		 770 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  24.84 
 
 		 757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  40.57 
 
 		 262 aa  125  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  24.37 
 
 		 750 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  38.52 
 
 		 116 aa  98.2  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  24.8 
 
 		 765 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  20.69 
 
 		 928 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  27.1 
 
 		 1148 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1176 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  22.17 
 
 		 948 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2146  hypothetical protein  22.85 
 
 		 784 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292237  normal  0.414458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>