29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5029 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  100 
 
 		 948 aa  1914    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  32.53 
 
 		 765 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  48.33 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  25.05 
 
 		 770 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  36.04 
 
 		 707 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  22.08 
 
 		 750 aa  90.1  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  31.47 
 
 		 1124 aa  88.6  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  36.49 
 
 		 1427 aa  87.4  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  35.14 
 
 		 1422 aa  82.4  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.78 
 
 		 1322 aa  81.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  31.79 
 
 		 1426 aa  77.8  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  23.9 
 
 		 1193 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  21.7 
 
 		 816 aa  62.4  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  24.49 
 
 		 758 aa  59.3  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  28.75 
 
 		 943 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  22.87 
 
 		 1148 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  21.04 
 
 		 1164 aa  48.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  23 
 
 		 1176 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  22.75 
 
 		 803 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  24.2 
 
 		 991 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  31.06 
 
 		 831 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  22.17 
 
 		 822 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  22.87 
 
 		 1479 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.11 
 
 		 1094 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  22.09 
 
 		 778 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  21.76 
 
 		 759 aa  45.8  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  23.6 
 
 		 842 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 835 aa  45.4  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14540  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.33 
 
 		 1034 aa  44.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>