16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2146 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4099  hypothetical protein  53.57 
 
 		 794 aa  873    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.457724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2146  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292237  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2742  hypothetical protein  56.47 
 
 		 770 aa  894    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2175  hypothetical protein  51.95 
 
 		 774 aa  819    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  21.38 
 
 		 1176 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 781 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  22.42 
 
 		 1193 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  31.45 
 
 		 759 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  39.06 
 
 		 770 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  32.74 
 
 		 833 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  23.38 
 
 		 811 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  26.44 
 
 		 778 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  21.65 
 
 		 1148 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  22.85 
 
 		 822 aa  44.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  30.48 
 
 		 741 aa  44.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  33.33 
 
 		 742 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>