56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  100 
 
 		 762 aa  1507    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  33.9 
 
 		 833 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  32.31 
 
 		 822 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  33.25 
 
 		 841 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  33.6 
 
 		 825 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  37.19 
 
 		 824 aa  362  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  31.61 
 
 		 802 aa  362  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  32.63 
 
 		 864 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  34.08 
 
 		 825 aa  353  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.09 
 
 		 1094 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  35.23 
 
 		 842 aa  350  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  35.74 
 
 		 741 aa  347  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  31.84 
 
 		 816 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  36.99 
 
 		 781 aa  345  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  30.74 
 
 		 786 aa  340  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  36.54 
 
 		 747 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  32.92 
 
 		 811 aa  337  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.93 
 
 		 784 aa  335  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  49.53 
 
 		 837 aa  332  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  30.1 
 
 		 868 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  32.74 
 
 		 768 aa  323  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  32.61 
 
 		 759 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  34.24 
 
 		 1139 aa  314  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 		 757 aa  315  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  47.62 
 
 		 646 aa  314  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  30.35 
 
 		 781 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  41.08 
 
 		 809 aa  310  5e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  43.85 
 
 		 856 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  30.56 
 
 		 1193 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  30.25 
 
 		 778 aa  303  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  29.28 
 
 		 790 aa  302  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  45.29 
 
 		 808 aa  299  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 		 835 aa  294  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  30.55 
 
 		 1164 aa  294  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  33.02 
 
 		 991 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  30.77 
 
 		 1479 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  31.65 
 
 		 819 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  31.05 
 
 		 803 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  28.82 
 
 		 760 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  33.87 
 
 		 742 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  29.68 
 
 		 758 aa  273  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  37.08 
 
 		 940 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  31.46 
 
 		 831 aa  250  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  27.14 
 
 		 788 aa  240  9e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  28.39 
 
 		 796 aa  230  6e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  30.68 
 
 		 773 aa  208  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  26.7 
 
 		 809 aa  187  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  29.59 
 
 		 809 aa  165  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  25.63 
 
 		 804 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  27.99 
 
 		 943 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  27.43 
 
 		 753 aa  111  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  24.25 
 
 		 770 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  38.1 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  29.39 
 
 		 928 aa  69.3  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  41.94 
 
 		 116 aa  68.6  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  21.83 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>