66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5219 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  66.56 
 
 
1148 aa  1160    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  100 
 
 
1176 aa  2339    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  58.84 
 
 
1357 aa  344  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  65.02 
 
 
778 aa  256  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  81.34 
 
 
723 aa  228  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  73.68 
 
 
682 aa  205  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  67.14 
 
 
542 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  73.44 
 
 
635 aa  195  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  70 
 
 
632 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  45.5 
 
 
1548 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  58.73 
 
 
384 aa  149  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  59.17 
 
 
438 aa  140  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  48.05 
 
 
358 aa  127  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  39.64 
 
 
727 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  51.91 
 
 
459 aa  125  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.65 
 
 
1212 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  43.41 
 
 
794 aa  116  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2645  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosaminidase  41.97 
 
 
512 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.708855  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  39.04 
 
 
1465 aa  99.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.15 
 
 
673 aa  95.9  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.18 
 
 
734 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.44 
 
 
627 aa  85.1  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  35.19 
 
 
694 aa  82.4  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.92 
 
 
603 aa  79.7  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  32.03 
 
 
552 aa  78.2  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  35.94 
 
 
986 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.6 
 
 
986 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.6 
 
 
986 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  35.6 
 
 
986 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.6 
 
 
986 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  34.39 
 
 
1084 aa  74.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.6 
 
 
955 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.6 
 
 
955 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.6 
 
 
964 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  31.22 
 
 
1089 aa  72.4  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  31.28 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  30.26 
 
 
646 aa  70.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  35.16 
 
 
639 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2597  hypothetical protein  29.63 
 
 
264 aa  70.1  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.24 
 
 
558 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  36.45 
 
 
1115 aa  65.1  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2146  hypothetical protein  21.38 
 
 
784 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292237  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  32.14 
 
 
961 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  62.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  31.71 
 
 
182 aa  58.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  31.71 
 
 
182 aa  58.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  31.71 
 
 
182 aa  58.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  28 
 
 
802 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  24.38 
 
 
646 aa  57.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  31.09 
 
 
768 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  27.87 
 
 
1075 aa  54.3  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  30.51 
 
 
1139 aa  53.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.73 
 
 
784 aa  53.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 
835 aa  53.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  22.66 
 
 
842 aa  52  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  28.96 
 
 
825 aa  52  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  23.48 
 
 
781 aa  51.6  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  26.12 
 
 
864 aa  50.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  20.29 
 
 
765 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  22.87 
 
 
841 aa  48.1  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  28.69 
 
 
1375 aa  48.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6291  hypothetical protein  26.78 
 
 
195 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  25.86 
 
 
822 aa  46.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  22.59 
 
 
948 aa  46.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  28.57 
 
 
1010 aa  45.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.01 
 
 
1094 aa  45.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>