70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6250 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 		 627 aa  1275    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  46.78 
 
 		 603 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  50.1 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  47.47 
 
 		 488 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  46.17 
 
 		 486 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  48.11 
 
 		 648 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  44.85 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  46.5 
 
 		 480 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  45.35 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.27 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  46.94 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.42 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  43.92 
 
 		 634 aa  365  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  45.11 
 
 		 666 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.44 
 
 		 497 aa  361  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.91 
 
 		 695 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  40.16 
 
 		 481 aa  326  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  40.94 
 
 		 481 aa  320  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  38.64 
 
 		 484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  36.11 
 
 		 647 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.13 
 
 		 501 aa  268  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  42.6 
 
 		 603 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  35.07 
 
 		 475 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  33.18 
 
 		 445 aa  226  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.71 
 
 		 982 aa  219  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  31.6 
 
 		 476 aa  206  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  29.4 
 
 		 446 aa  204  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  30.9 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  31.36 
 
 		 485 aa  191  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 		 445 aa  190  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  29.51 
 
 		 487 aa  173  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  61.36 
 
 		 1115 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  28.73 
 
 		 447 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  25.44 
 
 		 567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  28.61 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  31.02 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  52.74 
 
 		 409 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  27.12 
 
 		 445 aa  139  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  53.12 
 
 		 639 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  48.03 
 
 		 552 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  28.63 
 
 		 688 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  29.27 
 
 		 726 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  27.79 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  25.81 
 
 		 859 aa  117  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  42.52 
 
 		 1010 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.88 
 
 		 734 aa  97.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  27.23 
 
 		 413 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  28.07 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  40.52 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  36.64 
 
 		 723 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1176 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  41.38 
 
 		 542 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.97 
 
 		 1357 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  25.33 
 
 		 629 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  38.02 
 
 		 358 aa  73.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  28.76 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  36.21 
 
 		 682 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  36.21 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.04 
 
 		 635 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.52 
 
 		 632 aa  60.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.14 
 
 		 673 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  26.09 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  32.79 
 
 		 182 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  32.79 
 
 		 182 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  32.79 
 
 		 182 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  22.86 
 
 		 982 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.85 
 
 		 558 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  24.85 
 
 		 1217 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  20.76 
 
 		 630 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>